37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1364 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1364  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 345 aa  708    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0232  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.1 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3854  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.14 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.676972  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0236  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.48 
 
 		 381 aa  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0989  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.69 
 
 		 375 aa  99.8  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2720  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.02 
 
 		 375 aa  90.9  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5499  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.74 
 
 		 399 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.749951  normal  0.0277313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3228  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.92 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.139058 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2753  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2847  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453576  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.37 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2121  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.38 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1498  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.94 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0930511  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.23 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.178796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2783  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.44 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0990816  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1934  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.43 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2642  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.35 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.415202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2478  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.85 
 
 		 369 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2587  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.98 
 
 		 339 aa  52.8  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.140684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2662  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.99 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.273775  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.39 
 
 		 647 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5836  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.9 
 
 		 592 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.96 
 
 		 940 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.799398 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1518  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.55 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.010093  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3704  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.13 
 
 		 322 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1119  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.13 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1506  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.03 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135963  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03927  inositol phosphosphingolipid phospholipase C (Eurofung)  24.22 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.635574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  23.73 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0095  exodeoxyribonuclease III  25.32 
 
 		 271 aa  43.9  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2668  exodeoxyribonuclease III Xth  37.18 
 
 		 260 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.11 
 
 		 1266 aa  43.1  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0195  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.73 
 
 		 821 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937646  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0786  endonuclease/exonuclease/phosphatase fa  30.08 
 
 		 339 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1000  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1076 aa  42.7  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1020  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.59 
 
 		 358 aa  42.7  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.08 
 
 		 339 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23952  decreased coverage  0.00360154 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>