More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0095 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0095  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 
271 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2004  exodeoxyribonuclease III  61.8 
 
 
268 aa  350  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0962  exodeoxyribonuclease III Xth  61.42 
 
 
268 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1927  exodeoxyribonuclease III  61.8 
 
 
289 aa  350  2e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3233  exodeoxyribonuclease III Xth  59.02 
 
 
284 aa  345  5e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3054  exodeoxyribonuclease III  58.96 
 
 
268 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589919  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4090  exodeoxyribonuclease III Xth  55.81 
 
 
267 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424801  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3766  exodeoxyribonuclease III Xth  55.81 
 
 
267 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0278  exodeoxyribonuclease III (xth)  57.74 
 
 
270 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4232  exodeoxyribonuclease III  56.6 
 
 
267 aa  317  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00320873  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0444  exodeoxyribonuclease III Xth  54.98 
 
 
272 aa  313  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.0814808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0330  exodeoxyribonuclease III Xth  56.88 
 
 
270 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0159885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4400  exodeoxyribonuclease III Xth  54.92 
 
 
269 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.299594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4030  exodeoxyribonuclease III Xth  54.92 
 
 
269 aa  308  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2893  exodeoxyribonuclease III Xth  55.3 
 
 
269 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0284  exodeoxyribonuclease III Xth  54.44 
 
 
270 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.27736  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4512  exodeoxyribonuclease III Xth  54.55 
 
 
269 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.273616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0085  exodeoxyribonuclease III xth  54.24 
 
 
295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.780104  normal  0.0810533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0379  exodeoxyribonuclease III  54.17 
 
 
270 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4910  exodeoxyribonuclease III Xth  54.17 
 
 
269 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3746  exodeoxyribonuclease III Xth  53.79 
 
 
269 aa  300  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.0169792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0194  exodeoxyribonuclease III Xth  54.24 
 
 
290 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.074274  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0442  exodeoxyribonuclease III  52.96 
 
 
352 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0179  putative exodeoxyribonuclease III (xthA)  54.24 
 
 
271 aa  298  9e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0092  exodeoxyribonuclease III (xth)  52.79 
 
 
293 aa  296  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209408  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1294  exodeoxyribonuclease III Xth  52.77 
 
 
268 aa  295  5e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.956147  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2372  exodeoxyribonuclease III Xth  53.18 
 
 
261 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0036  exodeoxyribonuclease III  53.18 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000572838 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0053  exodeoxyribonuclease III  51.12 
 
 
262 aa  272  5.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0421  exodeoxyribonuclease III  49.81 
 
 
262 aa  262  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2671  exodeoxyribonuclease III (xth)  49.81 
 
 
264 aa  263  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.301429  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0414  exodeoxyribonuclease III Xth  51.15 
 
 
267 aa  259  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549191  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  49.63 
 
 
262 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24469  hitchhiker  0.00159144 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0045  exodeoxyribonuclease III Xth  51.14 
 
 
270 aa  257  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.278915  normal  0.0499995 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2506  exodeoxyribonuclease III Xth  49.25 
 
 
262 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0848  exodeoxyribonuclease III  49.25 
 
 
262 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0490344  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3788  exodeoxyribonuclease III Xth  51.35 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996968  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3190  exodeoxyribonuclease III  48.64 
 
 
263 aa  252  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5009  exodeoxyribonuclease III Xth  45.52 
 
 
268 aa  248  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2948  exodeoxyribonuclease III  47.01 
 
 
270 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3696  exodeoxyribonuclease III xth  43.57 
 
 
249 aa  209  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  38.7 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  34.73 
 
 
267 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  33.58 
 
 
263 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  34.73 
 
 
262 aa  148  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  35.61 
 
 
262 aa  148  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  35.79 
 
 
263 aa  148  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  34.98 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  35.88 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  35.47 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  34.07 
 
 
276 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  34.69 
 
 
281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  36.76 
 
 
279 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  34.35 
 
 
266 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  36.78 
 
 
260 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  35.5 
 
 
256 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  34.47 
 
 
266 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  36.5 
 
 
258 aa  143  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  36.26 
 
 
258 aa  142  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  37.04 
 
 
264 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  36.36 
 
 
254 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  33.82 
 
 
281 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  35.42 
 
 
264 aa  142  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  36.98 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  36.67 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  32.46 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  36.36 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  34.93 
 
 
270 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  36.47 
 
 
277 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  34.69 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  36.23 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  35.19 
 
 
282 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  37.16 
 
 
258 aa  139  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  37.16 
 
 
258 aa  139  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  36.86 
 
 
261 aa  138  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  35.09 
 
 
275 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  35.88 
 
 
267 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2221  exodeoxyribonuclease III  36.12 
 
 
270 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162729  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  34.72 
 
 
288 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  35.47 
 
 
275 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  37.96 
 
 
265 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  34.35 
 
 
259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  34.47 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  35.09 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  34.87 
 
 
258 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  34.21 
 
 
261 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  37.93 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  37.55 
 
 
256 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  35.38 
 
 
256 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  37.27 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0415  exodeoxyribonuclease III  34.2 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  34.2 
 
 
263 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  35.25 
 
 
254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5986  exodeoxyribonuclease III Xth  34.35 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2815  exodeoxyribonuclease III  34.44 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0879261  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  33.21 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0877  exodeoxyribonuclease III Xth  33.33 
 
 
264 aa  133  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1683  exodeoxyribonuclease III  34.83 
 
 
258 aa  133  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122396 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  33.21 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0897  exodeoxyribonuclease III  32.21 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>