29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3854 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3854  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 380 aa  790    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.676972  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0232  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  71.39 
 
 		 381 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0236  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  70.34 
 
 		 381 aa  558  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0989  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.67 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3228  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.95 
 
 		 385 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.139058 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5499  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.41 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.749951  normal  0.0277313 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2121  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 		 382 aa  116  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1364  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.14 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1498  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.03 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0930511  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1934  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.06 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.38 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2720  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.13 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2753  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.55 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2847  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.55 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453576  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.21 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.178796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02630  hypothetical protein  27.27 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249483  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2478  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.53 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2642  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.99 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.415202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1119  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.09 
 
 		 348 aa  53.9  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2662  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.07 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.273775  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1063  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.33 
 
 		 554 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1247  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  28.46 
 
 		 795 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0824  endonuclease/exonuclease/phosphatase, putative  24.39 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0502024  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1859  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.29 
 
 		 344 aa  43.9  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2587  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.21 
 
 		 339 aa  43.9  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.140684  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1169  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.4 
 
 		 343 aa  43.5  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0605  hypothetical protein  23.96 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.662935 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0946  hypothetical protein  30.34 
 
 		 342 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>