28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0946 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0946  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  708    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1220  hypothetical protein  39.82 
 
 		 363 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133242  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04510  hypothetical protein  39.31 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1119  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.88 
 
 		 348 aa  207  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02630  hypothetical protein  36.62 
 
 		 359 aa  203  5e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249483  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1431  hypothetical protein  32.58 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0605  hypothetical protein  34.8 
 
 		 413 aa  160  4e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.662935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1186  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.03 
 
 		 342 aa  159  6e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1377  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.62 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.94 
 
 		 341 aa  157  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1196  hypothetical protein  32.37 
 
 		 348 aa  153  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1180  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.68 
 
 		 347 aa  152  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.494829  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1021  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.62 
 
 		 342 aa  149  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1518  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.96 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.010093  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6766  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.73 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1169  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.42 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1506  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.13 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135963  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.81 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0006  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.79 
 
 		 499 aa  67  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0041  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.29 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.294388  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3448  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.26 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1027  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.87 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0904827  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2587  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  21.86 
 
 		 339 aa  52.8  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.140684  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1247  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 437 aa  50.4  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1372  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.64 
 
 		 480 aa  48.9  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0824  endonuclease/exonuclease/phosphatase, putative  24.48 
 
 		 431 aa  43.9  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0502024  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3854  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.34 
 
 		 380 aa  43.5  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.676972  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.23 
 
 		 810 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>