18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3448 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3448  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 301 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1021  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.26 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1186  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.63 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0946  hypothetical protein  24.26 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1431  hypothetical protein  26.29 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1196  hypothetical protein  23.58 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1169  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.63 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1180  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.62 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.494829  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.84 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04510  hypothetical protein  25.26 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1220  hypothetical protein  27.75 
 
 		 363 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133242  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1377  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.99 
 
 		 325 aa  53.1  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6766  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.66 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0605  hypothetical protein  22.62 
 
 		 413 aa  51.2  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.662935 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1518  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.34 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.010093  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3624  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.69 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1119  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.65 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02630  hypothetical protein  21.54 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>