28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1102 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 341 aa  711    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1377  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.45 
 
 		 325 aa  334  1e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1186  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.36 
 
 		 342 aa  315  5e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1021  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.23 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1180  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.84 
 
 		 347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.494829  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1196  hypothetical protein  47.42 
 
 		 348 aa  279  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1431  hypothetical protein  40.96 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0946  hypothetical protein  30.94 
 
 		 342 aa  157  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1119  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.11 
 
 		 348 aa  152  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04510  hypothetical protein  30.84 
 
 		 324 aa  142  8e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0605  hypothetical protein  31.23 
 
 		 413 aa  140  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.662935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1220  hypothetical protein  30.18 
 
 		 363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133242  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02630  hypothetical protein  29.21 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249483  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1518  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.94 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.010093  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6766  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.28 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1169  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.76 
 
 		 343 aa  99.8  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.32 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0006  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.22 
 
 		 499 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2587  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.35 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.140684  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1506  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.73 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135963  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3448  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.84 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0041  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.64 
 
 		 460 aa  54.7  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.294388  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1247  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.36 
 
 		 437 aa  55.5  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1027  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.63 
 
 		 347 aa  52.8  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0904827  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0989  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.26 
 
 		 375 aa  46.2  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1372  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 480 aa  45.8  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0232  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.7 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3228  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.33 
 
 		 385 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.139058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>