23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6766 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6766  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 326 aa  672    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0526  hypothetical protein  95.68 
 
 		 209 aa  321  8e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1169  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.44 
 
 		 343 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1518  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.27 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.010093  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_002950  PG0605  hypothetical protein  29.91 
 
 		 413 aa  120  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.662935 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1180  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.88 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.494829  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1377  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.49 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1186  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.52 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1196  hypothetical protein  28.22 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1119  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.89 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02630  hypothetical protein  28.44 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249483  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.28 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1431  hypothetical protein  27.52 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0946  hypothetical protein  26.73 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04510  hypothetical protein  27.41 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1220  hypothetical protein  26.3 
 
 		 363 aa  95.9  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133242  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1021  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.77 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.29 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1506  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.4 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135963  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5499  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.09 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.749951  normal  0.0277313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3448  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.66 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0006  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.71 
 
 		 499 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  23.94 
 
 		 2796 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>