45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1021 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1021  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
342 aa  709    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1186  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  56.64 
 
 
342 aa  420  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1180  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.87 
 
 
347 aa  397  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.494829  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1431  hypothetical protein  53.25 
 
 
331 aa  371  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1196  hypothetical protein  50.64 
 
 
348 aa  322  4e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1377  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.57 
 
 
325 aa  290  3e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.23 
 
 
341 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1119  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.58 
 
 
348 aa  165  8e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0946  hypothetical protein  27.62 
 
 
342 aa  149  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1220  hypothetical protein  29.14 
 
 
363 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133242  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04510  hypothetical protein  27.99 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0605  hypothetical protein  28.17 
 
 
413 aa  133  5e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.662935 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1518  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.99 
 
 
307 aa  119  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.010093  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02630  hypothetical protein  26.7 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249483  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
334 aa  95.1  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1506  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.88 
 
 
310 aa  91.7  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135963  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0006  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.26 
 
 
499 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6766  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.77 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2587  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.85 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.140684  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3448  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.26 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1027  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.25 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0904827  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1169  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.36 
 
 
343 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1372  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.55 
 
 
480 aa  51.2  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15630  predicted extracellular nuclease  29.66 
 
 
802 aa  51.6  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.35443  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0824  endonuclease/exonuclease/phosphatase, putative  25.23 
 
 
431 aa  50.1  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0502024  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2847  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.11 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453576  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3228  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.22 
 
 
385 aa  47  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.139058 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2753  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.11 
 
 
296 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.83 
 
 
647 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220034  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.76 
 
 
810 aa  46.2  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1073  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.32 
 
 
597 aa  44.3  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  22.63 
 
 
788 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  22.63 
 
 
788 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  23.36 
 
 
788 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.71 
 
 
788 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0195  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.74 
 
 
821 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937646  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0989  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.57 
 
 
375 aa  43.5  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0085  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.13 
 
 
598 aa  43.5  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5836  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.65 
 
 
592 aa  43.5  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2783  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.1 
 
 
313 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0990816  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.63 
 
 
788 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  22.63 
 
 
788 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.63 
 
 
788 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.63 
 
 
788 aa  43.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1075  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  21.9 
 
 
583 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>