34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0824 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0824  endonuclease/exonuclease/phosphatase, putative  100 
 
 
431 aa  862    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0502024  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1247  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.14 
 
 
437 aa  310  4e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0041  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.69 
 
 
460 aa  262  1e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.294388  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1372  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.61 
 
 
480 aa  248  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.97 
 
 
334 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1506  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.47 
 
 
310 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135963  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1027  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.82 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0904827  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0605  hypothetical protein  30.54 
 
 
413 aa  64.7  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.662935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3704  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.23 
 
 
322 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2587  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.46 
 
 
339 aa  60.1  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.140684  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04510  hypothetical protein  23.36 
 
 
324 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.89 
 
 
269 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1021  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.23 
 
 
342 aa  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1431  hypothetical protein  23.4 
 
 
331 aa  47.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0415  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  21.58 
 
 
263 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000792393 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0349  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  21.58 
 
 
263 aa  47.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000480173  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0345  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  21.58 
 
 
263 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.280877  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  19.54 
 
 
289 aa  47  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1180  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.58 
 
 
347 aa  47  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.494829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0472  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  21.81 
 
 
263 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289235  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0356  endonuclease/exonuclease/phosphatase  19.47 
 
 
263 aa  46.6  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0429  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  21.81 
 
 
263 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3854  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.39 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.676972  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2216  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.6 
 
 
243 aa  46.2  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0194229  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0483  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  21.81 
 
 
263 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307192  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0373  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  21.05 
 
 
263 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.888457  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2662  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.13 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.273775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4889  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  21.81 
 
 
263 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000170184  normal  0.405764 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.42 
 
 
228 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0359  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  21.58 
 
 
263 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.59313  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1119  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.69 
 
 
348 aa  44.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0208  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.33 
 
 
305 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0946  hypothetical protein  24.48 
 
 
342 aa  43.9  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.16 
 
 
258 aa  43.5  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>