31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1186 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1186  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 342 aa  713    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1021  endonuclease/exonuclease/phosphatase  56.64 
 
 		 342 aa  420  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1180  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.84 
 
 		 347 aa  391  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.494829  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1431  hypothetical protein  55.31 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1196  hypothetical protein  53.4 
 
 		 348 aa  331  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.36 
 
 		 341 aa  315  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1377  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.39 
 
 		 325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0946  hypothetical protein  30.03 
 
 		 342 aa  159  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1220  hypothetical protein  28.99 
 
 		 363 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133242  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1119  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.61 
 
 		 348 aa  142  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0605  hypothetical protein  30.53 
 
 		 413 aa  136  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.662935 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02630  hypothetical protein  26.63 
 
 		 359 aa  132  9e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249483  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04510  hypothetical protein  28.04 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1518  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.3 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.010093  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6766  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.52 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0006  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.08 
 
 		 499 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1506  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.56 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135963  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2587  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.9 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.140684  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1169  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.71 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.51 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3448  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.63 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0041  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.94 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.294388  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1247  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.17 
 
 		 437 aa  53.9  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1027  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.66 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0904827  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1372  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.3 
 
 		 480 aa  51.2  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.65 
 
 		 647 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15630  predicted extracellular nuclease  31.65 
 
 		 802 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.35443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0526  hypothetical protein  29.6 
 
 		 209 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2847  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.73 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453576  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5836  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.65 
 
 		 592 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0989  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.77 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>