30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1331 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1331  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  700    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1020  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.61 
 
 		 358 aa  281  8.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3781  hypothetical protein  43.94 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0801  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.19 
 
 		 355 aa  276  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.940089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000220  hypothetical protein  44.28 
 
 		 317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1308  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  40.54 
 
 		 410 aa  269  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.91 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1148  hypothetical protein  40.82 
 
 		 377 aa  266  5e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.42 
 
 		 403 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3519  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.68 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.546474  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0690  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.63 
 
 		 357 aa  263  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0327295  normal  0.622853 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.3 
 
 		 379 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.823594  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.33 
 
 		 402 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1007  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.39 
 
 		 377 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1059  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.16 
 
 		 408 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0969  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.39 
 
 		 377 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0973  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.12 
 
 		 377 aa  256  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.46 
 
 		 379 aa  243  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3245  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.87 
 
 		 377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05956  hypothetical protein  41.87 
 
 		 317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2966  hypothetical protein  37.16 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.14 
 
 		 346 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5248  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.84 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284119  normal  0.61528 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3785  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.25 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5372  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.42 
 
 		 352 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.05 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1653  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.77 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1043  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.01 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000546658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1330  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.42 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000015519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1506  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.6 
 
 		 310 aa  49.3  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>