37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1043 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1330  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  95.89 
 
 		 341 aa  681    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000015519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1043  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 341 aa  707    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000546658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1653  endonuclease/exonuclease/phosphatase  68.79 
 
 		 341 aa  464  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.04 
 
 		 346 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3785  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.02 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5372  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.21 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18295 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5248  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.61 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284119  normal  0.61528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.96 
 
 		 374 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0690  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.69 
 
 		 357 aa  93.6  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0327295  normal  0.622853 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0973  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.81 
 
 		 377 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1148  hypothetical protein  27.45 
 
 		 377 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0801  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.93 
 
 		 355 aa  86.3  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.940089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3781  hypothetical protein  25.54 
 
 		 381 aa  85.9  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3245  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.5 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1007  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.41 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0969  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.61 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.17 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1020  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.15 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05956  hypothetical protein  25.16 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000220  hypothetical protein  26 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3704  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.12 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2966  hypothetical protein  28.51 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1308  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.3 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3519  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.14 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.546474  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1331  hypothetical protein  23.01 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.38 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1059  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.69 
 
 		 408 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.05 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.27 
 
 		 402 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.79 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.823594  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0085  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 		 598 aa  48.1  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  20.62 
 
 		 788 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1073  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.58 
 
 		 597 aa  45.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.62 
 
 		 788 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2783  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.79 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0990816  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1498  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 		 370 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0930511  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.05 
 
 		 871 aa  42.7  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>