59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4762 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 299 aa  625  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2405  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  74.29 
 
 		 280 aa  434  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0821  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.13 
 
 		 281 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1565  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.33 
 
 		 279 aa  246  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.647267  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7169  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.13 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000224117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2048  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.45 
 
 		 274 aa  228  8e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.47219  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1018  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.93 
 
 		 289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.746967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1378  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.89 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0034  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 280 aa  152  7e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0129877 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  33.45 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.47 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2176  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.85 
 
 		 269 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2506  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.89 
 
 		 256 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.94 
 
 		 265 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0613  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.98 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.97974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1299  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.25 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2292  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.28 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0310197 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1572  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.5 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.816455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07690  metal-dependent hydrolase  30.83 
 
 		 270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0693  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.43 
 
 		 258 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30030  predicted protein  30.35 
 
 		 320 aa  112  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0364402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33238  conserved hypothetical protein  30.94 
 
 		 388 aa  111  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1311  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.94 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000133914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1127  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.46 
 
 		 262 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0546014  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06630  conserved hypothetical protein  34.29 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07298  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16830)  29.18 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0568351  normal  0.0631032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0522  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.35 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0458  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.29 
 
 		 303 aa  97.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2996  hypothetical protein  25.48 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49245  predicted protein  26.67 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.9 
 
 		 621 aa  73.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1779  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.28 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.82 
 
 		 635 aa  62.4  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.19 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.32 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.71 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2948  metal-dependent hydrolase-like  26 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.599718  normal  0.516446 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.48 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.79 
 
 		 328 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1397  hypothetical protein  38.67 
 
 		 160 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.67 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.15 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.77 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.67 
 
 		 235 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.83 
 
 		 249 aa  49.7  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0478352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.42 
 
 		 328 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6062  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.46 
 
 		 236 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0208  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.21 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.57 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.79 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.79 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.82 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.6 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4996  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.66 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13807  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.52 
 
 		 242 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.13 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  32.32 
 
 		 232 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.57 
 
 		 257 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.36 
 
 		 371 aa  42.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>