49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2176 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2176  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
269 aa  522  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.95 
 
 
299 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2405  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.71 
 
 
280 aa  156  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730344  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1018  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.18 
 
 
289 aa  151  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.746967  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1565  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.647267  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7169  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.14 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000224117  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2048  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.46 
 
 
274 aa  137  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.47219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2292  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.4 
 
 
262 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0310197 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0034  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.48 
 
 
280 aa  126  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0129877 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1378  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.19 
 
 
260 aa  125  9e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1311  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.89 
 
 
262 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000133914  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0821  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.27 
 
 
281 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1127  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.68 
 
 
262 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0546014  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1572  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.07 
 
 
284 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.816455  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  33.71 
 
 
319 aa  119  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2506  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.2 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.58 
 
 
298 aa  115  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0693  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.94 
 
 
258 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.97 
 
 
265 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30030  predicted protein  35.03 
 
 
320 aa  103  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0364402  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33238  conserved hypothetical protein  28.43 
 
 
388 aa  103  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0522  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.72 
 
 
305 aa  95.9  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1779  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.72 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1299  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.77 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06630  conserved hypothetical protein  31.73 
 
 
353 aa  87.4  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49245  predicted protein  23.65 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0613  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.92 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.97974  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07298  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16830)  28.2 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0568351  normal  0.0631032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0458  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.09 
 
 
303 aa  79  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471158  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07690  metal-dependent hydrolase  32.61 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.68 
 
 
621 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.35 
 
 
266 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2948  metal-dependent hydrolase-like  30.32 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.599718  normal  0.516446 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.82 
 
 
837 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.51 
 
 
314 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.32 
 
 
271 aa  49.3  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.55 
 
 
257 aa  48.9  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.1 
 
 
282 aa  48.9  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.41 
 
 
235 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.02 
 
 
257 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.47 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.79 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.85 
 
 
348 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.66 
 
 
312 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.43 
 
 
246 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4283  Metal-dependent exonuclease protein  24.33 
 
 
286 aa  42.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.53 
 
 
278 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2996  hypothetical protein  27.68 
 
 
302 aa  42.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.97 
 
 
289 aa  42.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>