35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30030 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_30030  predicted protein  100 
 
 		 320 aa  671    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0364402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33238  conserved hypothetical protein  36.77 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49245  predicted protein  35.57 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07298  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16830)  35.32 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0568351  normal  0.0631032 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1018  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.85 
 
 		 289 aa  135  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.746967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0821  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.68 
 
 		 281 aa  129  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06630  conserved hypothetical protein  36.73 
 
 		 353 aa  126  6e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2405  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.46 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7169  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.3 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000224117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.35 
 
 		 299 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2048  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 		 274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.47219  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1378  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.03 
 
 		 260 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1565  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.59 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.647267  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.52 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0034  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.7 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0129877 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1311  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.3 
 
 		 262 aa  92.4  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000133914  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0458  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.68 
 
 		 303 aa  92.4  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1127  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.3 
 
 		 262 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0546014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2176  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.85 
 
 		 269 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  30.26 
 
 		 319 aa  89.4  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1572  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.2 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.816455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2506  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.97 
 
 		 256 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0522  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.34 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2292  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.55 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0310197 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0693  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.94 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0613  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.58 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.97974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1299  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.27 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.09 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07690  metal-dependent hydrolase  25.93 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2948  metal-dependent hydrolase-like  25.45 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.599718  normal  0.516446 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1779  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.27 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.31 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.28 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26071  predicted protein  22.44 
 
 		 578 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.465211 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  19.85 
 
 		 675 aa  42.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>