43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1779 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1779  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 261 aa  543  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2506  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.89 
 
 		 256 aa  123  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1572  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.38 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.816455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  33.86 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2292  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.74 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0310197 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.78 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.85 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1565  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.2 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.647267  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1299  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.43 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0613  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.31 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.97974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1018  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.746967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2048  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.47219  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0821  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.57 
 
 		 281 aa  86.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0034  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.52 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0129877 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1311  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.52 
 
 		 262 aa  85.5  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000133914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1127  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.13 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0546014  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07690  metal-dependent hydrolase  29.39 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2176  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.95 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1378  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.52 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2405  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.34 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0458  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.73 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.62 
 
 		 621 aa  72.8  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2948  metal-dependent hydrolase-like  27.69 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.599718  normal  0.516446 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0693  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.9 
 
 		 258 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0522  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.83 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.28 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7169  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.32 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000224117  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07298  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16830)  25.4 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0568351  normal  0.0631032 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2996  hypothetical protein  26.33 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30030  predicted protein  24.27 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0364402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33238  conserved hypothetical protein  25.11 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4024  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.62 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.81 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.29 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0478352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.65 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 635 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.48 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06630  conserved hypothetical protein  28 
 
 		 353 aa  48.5  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.37 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.55 
 
 		 282 aa  45.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28 
 
 		 340 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0181271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1438  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.17 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0224  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.04 
 
 		 389 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.224894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>