61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0458 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0458  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 303 aa  635    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 		 298 aa  129  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.6 
 
 		 265 aa  125  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1378  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.23 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  28.9 
 
 		 319 aa  112  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2048  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.35 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.47219  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0522  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.92 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1572  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.65 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.816455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1018  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.07 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.746967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7169  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.53 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000224117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1311  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.45 
 
 		 262 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000133914  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1565  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.74 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.647267  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1127  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.09 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0546014  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2506  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.86 
 
 		 256 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07690  metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1299  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.69 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.29 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2405  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.07 
 
 		 280 aa  96.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0821  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.95 
 
 		 281 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30030  predicted protein  27.68 
 
 		 320 aa  92.4  8e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0364402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2292  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.94 
 
 		 262 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0310197 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0613  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.65 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.97974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0034  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.87 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0129877 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0693  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.04 
 
 		 258 aa  90.9  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33238  conserved hypothetical protein  28.41 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49245  predicted protein  24.2 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06630  conserved hypothetical protein  28.91 
 
 		 353 aa  75.5  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1779  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.73 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2996  hypothetical protein  25.49 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2176  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.21 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.62 
 
 		 621 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2948  metal-dependent hydrolase-like  25.5 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.599718  normal  0.516446 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2321  putative secreted protein  28.73 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000899939  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0246  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.8 
 
 		 389 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2562  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.13 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0854  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.78 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2679  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.91 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00635777  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0938  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.86 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.14 
 
 		 389 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.683267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00774  hypothetical protein  23.78 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00757  predicted DNase  23.78 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2852  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.78 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.350943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0844  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.78 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0813  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.78 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0192282  normal  0.85473 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2853  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.78 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512011 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.78 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0181271  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07298  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16830)  25.99 
 
 		 300 aa  49.3  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0568351  normal  0.0631032 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0224  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.49 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.224894  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.77 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1397  hypothetical protein  38.75 
 
 		 160 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.69 
 
 		 576 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1508  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.12 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1438  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.76 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.38 
 
 		 837 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1289  hypothetical protein  23.08 
 
 		 290 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal  0.614576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.51 
 
 		 288 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.83 
 
 		 282 aa  42.7  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.93 
 
 		 312 aa  42.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2668  hypothetical protein  25.24 
 
 		 278 aa  42.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.621647  normal  0.164223 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1958  hypothetical protein  26.02 
 
 		 276 aa  42.4  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>