22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0246 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0224  endonuclease/exonuclease/phosphatase  92.8 
 
 
389 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.224894  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  95.63 
 
 
389 aa  656    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.683267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0246  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
389 aa  766    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3092  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.27 
 
 
387 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3948  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.25 
 
 
470 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284355  normal  0.0358268 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.99 
 
 
340 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0181271  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0906  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.28 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0458  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.92 
 
 
303 aa  57  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471158  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.91 
 
 
265 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1364  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.82 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.204083  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2996  hypothetical protein  28.42 
 
 
302 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07690  metal-dependent hydrolase  37.74 
 
 
270 aa  46.6  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0998  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.25 
 
 
248 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0392935  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4024  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27 
 
 
278 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.56 
 
 
639 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.21 
 
 
591 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0303  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.65 
 
 
249 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401875  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.4 
 
 
278 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1779  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.67 
 
 
261 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  28.21 
 
 
639 aa  43.5  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7068  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.37 
 
 
1007 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332521  normal  0.746742 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  35.05 
 
 
316 aa  43.1  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>