189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_118 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  93.06 
 
 
591 aa  1064    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  100 
 
 
639 aa  1254    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  87.32 
 
 
639 aa  1098    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.54 
 
 
644 aa  160  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  34.26 
 
 
657 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.86 
 
 
278 aa  130  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  29.15 
 
 
673 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.71 
 
 
289 aa  120  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  27.08 
 
 
617 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5408  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.41 
 
 
634 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521256  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.02 
 
 
281 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.57 
 
 
278 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.54 
 
 
266 aa  100  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  31.98 
 
 
286 aa  97.8  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.39 
 
 
312 aa  90.5  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.93 
 
 
837 aa  89.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.56 
 
 
244 aa  88.6  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.45 
 
 
808 aa  88.2  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.49 
 
 
236 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.52 
 
 
271 aa  83.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.98 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.13 
 
 
260 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.83 
 
 
242 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.25 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.05 
 
 
242 aa  77  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.86 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.13 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.1 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.5 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.3 
 
 
283 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.88 
 
 
288 aa  73.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29 
 
 
266 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.54 
 
 
253 aa  72.8  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.52 
 
 
257 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.83 
 
 
246 aa  72  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.46 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.28 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.24 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1438  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.2 
 
 
291 aa  70.5  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.67 
 
 
249 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.86 
 
 
261 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0008  hypothetical protein  34.88 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326697  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.94 
 
 
288 aa  67  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6062  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.71 
 
 
236 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.56 
 
 
252 aa  67  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.5 
 
 
259 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.86 
 
 
282 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  26.64 
 
 
245 aa  66.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.73 
 
 
265 aa  65.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.09 
 
 
328 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0048  hypothetical protein  31.2 
 
 
256 aa  64.3  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.67 
 
 
283 aa  64.3  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
250 aa  64.3  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.54 
 
 
576 aa  64.3  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.74 
 
 
258 aa  63.9  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
263 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
263 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.83 
 
 
278 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.68 
 
 
255 aa  63.9  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.68 
 
 
255 aa  63.9  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.74 
 
 
250 aa  63.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.63 
 
 
257 aa  63.9  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.4 
 
 
300 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.673881  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.16 
 
 
228 aa  62.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.32 
 
 
300 aa  61.6  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1349  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.34 
 
 
287 aa  61.6  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.442404  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.84 
 
 
298 aa  61.6  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.71 
 
 
328 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.15 
 
 
258 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4283  Metal-dependent exonuclease protein  28.38 
 
 
286 aa  61.6  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.87 
 
 
255 aa  60.8  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.36 
 
 
371 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 
247 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.9 
 
 
268 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.49 
 
 
269 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4056  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.44 
 
 
264 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.08 
 
 
312 aa  59.7  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1787  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.44 
 
 
264 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.717183  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3655  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.74 
 
 
264 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0227458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2515  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.3 
 
 
256 aa  58.9  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.54 
 
 
279 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  33.96 
 
 
338 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.96 
 
 
338 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3150  hypothetical protein  32.16 
 
 
245 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2538  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.56 
 
 
260 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.14 
 
 
269 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4122  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.96 
 
 
287 aa  57.8  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3724  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.54 
 
 
279 aa  57.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.91 
 
 
264 aa  57  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.01 
 
 
370 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.27 
 
 
245 aa  56.6  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05011  integral plasma membrane protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09740)  28.15 
 
 
949 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0782168  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.79 
 
 
365 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.163228  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.94 
 
 
248 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00757  predicted DNase  27.86 
 
 
253 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36680  hypothetical protein  31.98 
 
 
245 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21271  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  30.41 
 
 
316 aa  55.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0844  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.86 
 
 
253 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0854  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.86 
 
 
253 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2853  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.86 
 
 
253 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512011 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>