159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0649 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  100 
 
 
250 aa  517  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  99.6 
 
 
258 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.04 
 
 
276 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2393  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.39 
 
 
277 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0093  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.33 
 
 
294 aa  195  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.45 
 
 
288 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0051  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.8 
 
 
292 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.171004 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3567  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.48 
 
 
286 aa  181  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.34 
 
 
245 aa  180  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.325788  normal  0.617389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5100  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.49 
 
 
284 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0779207 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2601  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  41.87 
 
 
282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.792599  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01980  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  43.57 
 
 
286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.496471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0143  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.08 
 
 
284 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0159  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.41 
 
 
290 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.171713  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72430  hypothetical protein  40.76 
 
 
292 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6287  hypothetical protein  40.76 
 
 
274 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.37 
 
 
290 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.742577  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0128  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.68 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503703  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0267  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.46 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0145  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.68 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2166  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.66 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0340  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  38.46 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04435  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.89 
 
 
255 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0781  hypothetical protein  39.32 
 
 
256 aa  166  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.32 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.4725  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.57 
 
 
271 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.635423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.18 
 
 
244 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.88 
 
 
242 aa  88.6  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1193  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.1 
 
 
244 aa  79  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.9 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.78 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  29.33 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.76 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.34 
 
 
837 aa  71.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.96 
 
 
242 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.02 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.71 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.32 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.42 
 
 
639 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.78 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.62 
 
 
808 aa  66.2  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.29 
 
 
591 aa  65.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.93 
 
 
279 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  32.74 
 
 
639 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.2 
 
 
255 aa  62  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3798  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00159012  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.38 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  30.5 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.38 
 
 
246 aa  60.1  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.77 
 
 
312 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  32.8 
 
 
273 aa  59.3  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
232 aa  59.3  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.02 
 
 
278 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.54 
 
 
250 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.88 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.88 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29 
 
 
328 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.27 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.56 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.91 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.86 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.91 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.62 
 
 
287 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.85 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.19 
 
 
265 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1010  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.47 
 
 
261 aa  56.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.78 
 
 
338 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.27 
 
 
258 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.81 
 
 
258 aa  56.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  33.78 
 
 
338 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.87 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
328 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4016  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.86 
 
 
276 aa  55.5  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.74 
 
 
265 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.94 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4337  putative metal-dependent hydrolase  31.74 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3049  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.94 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.687036  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.78 
 
 
1153 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.44 
 
 
644 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.19 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
244 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.84 
 
 
271 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.16 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3096  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.35 
 
 
271 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.35 
 
 
271 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0213  hypothetical protein  32.16 
 
 
230 aa  52.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.84 
 
 
260 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0102  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.94 
 
 
265 aa  52  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.98 
 
 
250 aa  52  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3294  hypothetical protein  32.95 
 
 
230 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.87 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0429  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.95 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2960  hypothetical protein  32.95 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2128  hypothetical protein  32.95 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0235  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.95 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0247  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.95 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.94 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.54 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>