208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3204 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.59 
 
 
228 aa  242  5e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  49.13 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.21 
 
 
258 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.21 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.21 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.64 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.22 
 
 
250 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.33 
 
 
269 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  51.28 
 
 
338 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.78 
 
 
278 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.33 
 
 
269 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  50.85 
 
 
338 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  51.08 
 
 
1153 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.98 
 
 
232 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.54 
 
 
226 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.39 
 
 
285 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  42.56 
 
 
285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  42.15 
 
 
285 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  43.04 
 
 
299 aa  159  6e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.86 
 
 
287 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.77 
 
 
271 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.77 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40 
 
 
271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.3 
 
 
240 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0472  hypothetical protein  45.19 
 
 
240 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2124  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.19 
 
 
240 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.908976 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.91 
 
 
264 aa  139  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.42 
 
 
265 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  42.62 
 
 
277 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.87 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.19 
 
 
233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.4 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.8 
 
 
292 aa  125  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.34 
 
 
247 aa  121  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1916  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.39 
 
 
230 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.37 
 
 
231 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.23 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.11 
 
 
328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.63 
 
 
283 aa  115  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.17 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.13 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.76 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
243 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35 
 
 
245 aa  112  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.33 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.86 
 
 
242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2216  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.54 
 
 
243 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0194229  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 
266 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.88 
 
 
244 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.3 
 
 
242 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  32.93 
 
 
245 aa  99  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.92 
 
 
244 aa  98.6  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.02 
 
 
246 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.72 
 
 
808 aa  96.7  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.74 
 
 
242 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.86 
 
 
257 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3278  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.44 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.73 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.33 
 
 
837 aa  93.6  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.59 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3265  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.99 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585826  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2495  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.99 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.39 
 
 
281 aa  92  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2631  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.99 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.363839 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3724  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.64 
 
 
279 aa  90.1  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.74 
 
 
245 aa  89.7  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.94 
 
 
257 aa  89.4  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.93 
 
 
253 aa  89  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.27 
 
 
279 aa  88.6  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.91 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.08 
 
 
251 aa  87.8  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.91 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3504  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.69 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.48 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.37 
 
 
251 aa  86.3  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3655  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.2 
 
 
264 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0227458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.95 
 
 
259 aa  85.5  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4056  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.98 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.87 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.33 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1787  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.98 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.717183  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.4 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  26.91 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1158  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.98 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.426304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.23 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  26.91 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2538  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.58 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.05 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4059  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.19 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2645  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.45 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150024  normal  0.299573 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1028  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.58 
 
 
255 aa  82  0.000000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2424  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.63 
 
 
253 aa  82  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.23 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5036  aminoacyl-tRNA hydrolase  32 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0185176 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0606  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.98 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.26 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0014  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.12 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.32 
 
 
267 aa  79  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2515  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.02 
 
 
256 aa  79  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>