192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0846 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 292 aa  578  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  57.47 
 
 		 287 aa  298  8e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  57.26 
 
 		 285 aa  285  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  56.22 
 
 		 285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  55.82 
 
 		 285 aa  282  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  57.2 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.69 
 
 		 271 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  46.67 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  51.72 
 
 		 277 aa  235  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.1 
 
 		 240 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0472  hypothetical protein  52.82 
 
 		 240 aa  221  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2124  endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.82 
 
 		 240 aa  221  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.908976 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.65 
 
 		 226 aa  152  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.71 
 
 		 232 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.95 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.47 
 
 		 231 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1916  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.17 
 
 		 230 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.87 
 
 		 228 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.37 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.8 
 
 		 259 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4059  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.79 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  36.8 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.17 
 
 		 250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.1 
 
 		 264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.6 
 
 		 265 aa  109  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.57 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.22 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.66 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.78 
 
 		 258 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.25 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.33 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.33 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.18 
 
 		 260 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.78 
 
 		 253 aa  102  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.06 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.14 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.07 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.74 
 
 		 231 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.6 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.4 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.73 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.55 
 
 		 808 aa  97.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.07 
 
 		 328 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.4 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2216  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.86 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0194229  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.38 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.16 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.66 
 
 		 837 aa  93.6  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.2 
 
 		 246 aa  93.6  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.64 
 
 		 242 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.8 
 
 		 245 aa  92.4  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.69 
 
 		 282 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  33.07 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.47 
 
 		 235 aa  88.2  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.67 
 
 		 243 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  29.03 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0445  endonuclease / exonuclease / phosphatase family protein  30.64 
 
 		 251 aa  87.4  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.625659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.82 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  36.4 
 
 		 338 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.4 
 
 		 338 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.87 
 
 		 255 aa  86.3  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.87 
 
 		 255 aa  86.3  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.65 
 
 		 255 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3767  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.92 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.96 
 
 		 1153 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.4 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.52 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3642  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748827  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  31.45 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.45 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.5 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.73 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.47 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.6 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.73 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0048  hypothetical protein  31.47 
 
 		 256 aa  75.5  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  32.52 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5036  aminoacyl-tRNA hydrolase  31.73 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185176 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3616  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.31 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.53 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.23 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.8 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  28.79 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  29.37 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3278  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.92 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.99 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2631  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.98 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363839 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1391  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.21 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.58 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0854  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.31 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2284  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.98 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0656369  hitchhiker  0.000754964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2495  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.54 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00757  predicted DNase  30.31 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0844  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.31 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2853  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.31 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512011 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00774  hypothetical protein  30.31 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>