226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0692 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
245 aa  487  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.79 
 
 
231 aa  238  9e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1916  endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.34 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  39.67 
 
 
285 aa  149  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.08 
 
 
285 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0472  hypothetical protein  43.4 
 
 
240 aa  148  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2124  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.4 
 
 
240 aa  148  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.908976 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  39.26 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.93 
 
 
236 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.22 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.26 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.15 
 
 
271 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.51 
 
 
299 aa  135  4e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4059  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.83 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  43.88 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.37 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.76 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.67 
 
 
287 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.75 
 
 
232 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.22 
 
 
226 aa  118  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.9 
 
 
250 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.04 
 
 
228 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.48 
 
 
233 aa  112  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35 
 
 
259 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  36.1 
 
 
273 aa  105  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.73 
 
 
246 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.27 
 
 
246 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32 
 
 
246 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2216  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.93 
 
 
243 aa  101  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0194229  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.45 
 
 
269 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.13 
 
 
242 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.74 
 
 
266 aa  99.4  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.45 
 
 
269 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.76 
 
 
258 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.33 
 
 
263 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.33 
 
 
263 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.19 
 
 
278 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.45 
 
 
242 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.77 
 
 
283 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.17 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.05 
 
 
837 aa  93.6  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.15 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  34.16 
 
 
338 aa  88.6  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.13 
 
 
242 aa  88.6  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.16 
 
 
338 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.46 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.54 
 
 
261 aa  85.5  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.47 
 
 
1153 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.54 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.54 
 
 
328 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.8 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.14 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.44 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.59 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.37 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.37 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  31.47 
 
 
248 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0570  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.4 
 
 
250 aa  82  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.98478  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.62 
 
 
251 aa  82  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.63 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.81 
 
 
250 aa  81.6  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  31.92 
 
 
286 aa  81.6  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.98 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.08 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  30.95 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2495  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.52 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.69 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.88 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  30.47 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3265  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.52 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585826  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.88 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.08 
 
 
257 aa  79  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1028  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.28 
 
 
255 aa  79  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1158  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.28 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.426304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2645  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.4 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150024  normal  0.299573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.07 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0606  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.56 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2631  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.52 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.363839 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.72 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  30.83 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0014  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.23 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.92 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.92 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.92 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3642  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.59 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.33 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.8 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.11 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36680  hypothetical protein  29.27 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21271  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.15 
 
 
808 aa  73.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0445  endonuclease / exonuclease / phosphatase family protein  30.2 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.625659 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1391  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.85 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.12 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2515  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.6 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  25.97 
 
 
257 aa  72  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  25.97 
 
 
257 aa  72  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3150  hypothetical protein  29.27 
 
 
245 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>