142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4612 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
268 aa  535  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.74 
 
 
281 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.73 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.74 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.17 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  31.91 
 
 
286 aa  75.5  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.4 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3678  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.82 
 
 
437 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.322426 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.53 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  30.94 
 
 
673 aa  72.4  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.12 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0469  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.62 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2113  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.22 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0578211  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5408  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.03 
 
 
634 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521256  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2766  hypothetical protein  30.9 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.48 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.63 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2093  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.67 
 
 
284 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.84 
 
 
300 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.91 
 
 
242 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.51 
 
 
837 aa  63.5  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28 
 
 
591 aa  62.8  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.74 
 
 
644 aa  62.4  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.85 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.52 
 
 
808 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.06 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.11 
 
 
236 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.9 
 
 
246 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  28.17 
 
 
639 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.6 
 
 
284 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533258  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.43 
 
 
258 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.4 
 
 
269 aa  59.7  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.43 
 
 
263 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.43 
 
 
263 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.12 
 
 
338 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.53 
 
 
246 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  34.12 
 
 
338 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.1 
 
 
242 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.29 
 
 
639 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.42 
 
 
283 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  32.68 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1842  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.49 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108875 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.51 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.94 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.08 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1364  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.53 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.204083  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.18 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.18 
 
 
328 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.92 
 
 
576 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.18 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1756  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.62 
 
 
286 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002767  hypothetical protein  38.55 
 
 
281 aa  56.2  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.306762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3303  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.8 
 
 
291 aa  55.8  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.12 
 
 
1153 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.51 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.67 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2656  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.78 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3278  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.67 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5302  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.71 
 
 
289 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.52 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.47 
 
 
258 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.12 
 
 
278 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.13 
 
 
231 aa  53.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.95 
 
 
244 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.45 
 
 
261 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.38 
 
 
252 aa  52.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1455  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.91 
 
 
285 aa  52.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271612  normal  0.540274 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  27.31 
 
 
245 aa  52.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.91 
 
 
283 aa  52  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1729  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.57 
 
 
284 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102373  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.27 
 
 
260 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.69 
 
 
257 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.05 
 
 
261 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1144  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.04 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.67 
 
 
245 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2645  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.17 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150024  normal  0.299573 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0964  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.44 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4024  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.89 
 
 
278 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.12 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  26.67 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.65 
 
 
282 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6261  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 
284 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 
284 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.48 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.46 
 
 
249 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.8 
 
 
264 aa  49.7  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.76 
 
 
235 aa  49.3  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2394  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.23 
 
 
243 aa  49.3  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  26.3 
 
 
257 aa  49.3  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  29.23 
 
 
657 aa  49.3  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.95 
 
 
279 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.05 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3655  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.34 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0227458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2679  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.61 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00635777  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4056  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.95 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1787  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.95 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.717183  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03217  hypothetical protein  34.94 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  28.28 
 
 
617 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1052  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00191941  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6062  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.59 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>