37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07690 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_07690  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
270 aa  530  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.33 
 
 
298 aa  187  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1565  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.74 
 
 
279 aa  139  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.647267  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0821  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 
281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2048  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.56 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.47219  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.06 
 
 
299 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1311  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.77 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000133914  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7169  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.51 
 
 
308 aa  126  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000224117  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2405  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.82 
 
 
280 aa  122  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730344  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1127  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.01 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0546014  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1378  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.33 
 
 
260 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0522  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.03 
 
 
305 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1572  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.89 
 
 
284 aa  105  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.816455  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  32.05 
 
 
319 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2506  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.99 
 
 
256 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0034  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.04 
 
 
280 aa  102  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0129877 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06630  conserved hypothetical protein  35.29 
 
 
353 aa  100  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1018  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.71 
 
 
289 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.746967  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0458  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.37 
 
 
303 aa  99.4  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471158  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0693  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.84 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1299  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.85 
 
 
271 aa  95.5  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0613  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.89 
 
 
291 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.97974  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30030  predicted protein  26.67 
 
 
320 aa  91.7  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0364402  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.75 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1779  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
261 aa  85.5  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2292  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.84 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0310197 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33238  conserved hypothetical protein  30.2 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07298  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16830)  28.74 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0568351  normal  0.0631032 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2176  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.11 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49245  predicted protein  28.39 
 
 
318 aa  62.8  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.77 
 
 
621 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2996  hypothetical protein  28.65 
 
 
302 aa  53.1  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.16 
 
 
635 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0998  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.77 
 
 
248 aa  48.9  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0392935  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.1 
 
 
644 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0040  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.79 
 
 
329 aa  43.5  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0808  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.51 
 
 
257 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.555445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>