21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_26071 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009364  OSTLU_26071  predicted protein  100 
 
 
578 aa  1211    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.465211 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42429  predicted protein  35.41 
 
 
625 aa  274  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03790  conserved hypothetical protein  32.11 
 
 
744 aa  191  4e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  30 
 
 
675 aa  188  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43289  predicted protein  28.03 
 
 
401 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43396  predicted protein  28.03 
 
 
401 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55298  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (Cytoplasmic deadenylase) (Carbon catabolite repressor protein 4)  25.49 
 
 
369 aa  99.4  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00447743  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37444  predicted protein  25.53 
 
 
382 aa  98.2  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00833047  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45096  predicted protein  24.45 
 
 
765 aa  89.7  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37824  predicted protein  24.37 
 
 
304 aa  85.9  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.725866  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26290  predicted protein  25.19 
 
 
349 aa  77  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.176681 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48873  predicted protein  24.63 
 
 
808 aa  67.4  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.424343  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35882  RNA exonuclease NGL2 (Carbon catabolite repressor protein 4 homolog)  25.66 
 
 
463 aa  62  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185084  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02360  expressed protein  23.11 
 
 
527 aa  57.4  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0693  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.8 
 
 
258 aa  54.7  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05370  phospholipase C, putative  24.83 
 
 
529 aa  50.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.51 
 
 
621 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_87984  predicted protein  24.8 
 
 
360 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.457864  normal  0.0548409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.94 
 
 
269 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43144  predicted protein  22.76 
 
 
409 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471661  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30030  predicted protein  22.44 
 
 
320 aa  43.9  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0364402  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>