22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48873 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_48873  predicted protein  100 
 
 		 808 aa  1679    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.424343  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26071  predicted protein  24.82 
 
 		 578 aa  67.4  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.465211 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42429  predicted protein  26.83 
 
 		 625 aa  61.2  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43289  predicted protein  27.16 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43396  predicted protein  27.16 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02360  expressed protein  23.08 
 
 		 527 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1519  hypothetical protein  28.76 
 
 		 241 aa  57  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00627759  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  23.02 
 
 		 675 aa  57  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03790  conserved hypothetical protein  22.15 
 
 		 744 aa  55.8  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3958  protein of unknown function DUF82  29.22 
 
 		 243 aa  54.7  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1548  hypothetical protein  28.57 
 
 		 258 aa  53.5  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3040  protein of unknown function DUF82  26.32 
 
 		 261 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3080  protein of unknown function DUF82  25.73 
 
 		 261 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.367373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0072  hypothetical protein  31.9 
 
 		 158 aa  51.6  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.0153972 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55298  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (Cytoplasmic deadenylase) (Carbon catabolite repressor protein 4)  20.08 
 
 		 369 aa  51.6  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00447743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0155  hypothetical protein  29.61 
 
 		 166 aa  50.8  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.292503  normal  0.0192044 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2621  hypothetical protein  28.39 
 
 		 152 aa  50.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1988  protein of unknown function DUF82  28.67 
 
 		 254 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.865468  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0418  hypothetical protein  29.33 
 
 		 262 aa  47  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10590  hypothetical protein  27.37 
 
 		 252 aa  46.6  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.18585e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.02 
 
 		 235 aa  44.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0859  hypothetical protein  25.79 
 
 		 267 aa  44.3  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.015676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>