70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1988 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1988  protein of unknown function DUF82  100 
 
 		 254 aa  513  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.865468  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3352  protein of unknown function DUF82  52.07 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.729294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3276  protein of unknown function DUF82  49.17 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.31629  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0281  protein of unknown function DUF82  45.23 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0418  hypothetical protein  46.3 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0327  hypothetical protein  42.74 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359144  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3040  protein of unknown function DUF82  38.62 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3080  protein of unknown function DUF82  38.21 
 
 		 261 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.367373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0147  hypothetical protein  41.63 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0149  hypothetical protein  41.63 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2158  hypothetical protein  42 
 
 		 264 aa  188  9e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10590  hypothetical protein  42.92 
 
 		 252 aa  188  9e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.18585e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0859  hypothetical protein  43.57 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.015676 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0146  hypothetical protein  38.71 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.865977  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0217  hypothetical protein  40.65 
 
 		 247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2878  hypothetical protein  38.06 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000157183  hitchhiker  0.00000000000184345 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0270  hypothetical protein  39.69 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318554  hitchhiker  0.00000949427 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3123  hypothetical protein  40.56 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0157534  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3802  hypothetical protein  39.52 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142796  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1634  hypothetical protein  39.26 
 
 		 251 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0031  hypothetical protein  39.43 
 
 		 251 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3863  hypothetical protein  39.43 
 
 		 251 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3686  protein of unknown function DUF82  38.96 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000683757  hitchhiker  0.000000000000406532 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  40.33 
 
 		 254 aa  165  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0174  hypothetical protein  37.01 
 
 		 266 aa  161  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1285  hypothetical protein  36.33 
 
 		 244 aa  161  9e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3405  hypothetical protein  38.11 
 
 		 254 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000396149  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0209  hypothetical protein  38.28 
 
 		 246 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121486  unclonable  0.00000000000711775 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3958  protein of unknown function DUF82  38.66 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1548  hypothetical protein  40.6 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0306  hypothetical protein  37.7 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00785467  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2800  hypothetical protein  37.7 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4229  protein of unknown function DUF82  35.51 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4339  protein of unknown function DUF82  35.51 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.172322 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1812  protein of unknown function DUF82  40.16 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1519  hypothetical protein  35 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00627759  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02617  hypothetical protein  36.55 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0233  hypothetical protein  35.77 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0265996  hitchhiker  0.00000000670922 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0225  hypothetical protein  35.66 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7452  protein of unknown function DUF82  37.85 
 
 		 262 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0403  hypothetical protein  42.58 
 
 		 167 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.393997  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2400  protein of unknown function DUF82  37.21 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2002  protein of unknown function DUF82  38.46 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0341  protein of unknown function DUF82  39.33 
 
 		 158 aa  121  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00210637  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_368  hypothetical protein  38.65 
 
 		 167 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0577491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0100  protein of unknown function DUF82  41.01 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.566034  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0072  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  89.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.0153972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2621  hypothetical protein  39.61 
 
 		 152 aa  89.4  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0747  hypothetical protein  39.33 
 
 		 192 aa  86.7  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0758  hypothetical protein  35.58 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1425  hypothetical protein  34.93 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1471  hypothetical protein  32.91 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.863306  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1033  hypothetical protein  34.48 
 
 		 148 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1962  protein of unknown function DUF82  36.91 
 
 		 155 aa  73.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00000351454  decreased coverage  0.00501017 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0872  protein of unknown function DUF82  35.1 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.340382  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2987  protein of unknown function DUF82  35.95 
 
 		 153 aa  71.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3160  hypothetical protein  38.99 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0155  hypothetical protein  28.74 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.292503  normal  0.0192044 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0441  protein of unknown function DUF82  31.4 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.297493 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1135  protein of unknown function DUF82  31.52 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.132995  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1053  hypothetical protein  29.93 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1691  hypothetical protein  31.58 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000104629  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1175  protein of unknown function DUF82  25.97 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1020  hypothetical protein  29.25 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.134843 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2635  protein of unknown function DUF82  31.85 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1591  hypothetical protein  29.66 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1167  hypothetical protein  36.5 
 
 		 126 aa  53.5  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48873  predicted protein  28.67 
 
 		 808 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.424343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0219  protein of unknown function DUF82  32.95 
 
 		 167 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.375339  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1779  hypothetical protein  28.75 
 
 		 162 aa  45.8  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000347212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>