76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0174 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0174  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  544  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0217  hypothetical protein  80.89 
 
 		 247 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2878  hypothetical protein  72.76 
 
 		 251 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000157183  hitchhiker  0.00000000000184345 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0146  hypothetical protein  70.04 
 
 		 251 aa  360  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.865977  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3686  protein of unknown function DUF82  68.53 
 
 		 253 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000683757  hitchhiker  0.000000000000406532 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1634  hypothetical protein  70.2 
 
 		 251 aa  356  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2158  hypothetical protein  67.2 
 
 		 264 aa  355  5.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0270  hypothetical protein  69.11 
 
 		 251 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318554  hitchhiker  0.00000949427 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0031  hypothetical protein  68.72 
 
 		 251 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3863  hypothetical protein  68.72 
 
 		 251 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3123  hypothetical protein  68.72 
 
 		 251 aa  346  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0157534  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3802  hypothetical protein  68.72 
 
 		 251 aa  345  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  63.52 
 
 		 254 aa  329  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0209  hypothetical protein  56.23 
 
 		 246 aa  258  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121486  unclonable  0.00000000000711775 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2800  hypothetical protein  51.7 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0306  hypothetical protein  51.7 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00785467  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3405  hypothetical protein  54.32 
 
 		 254 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000396149  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0233  hypothetical protein  53.06 
 
 		 255 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0265996  hitchhiker  0.00000000670922 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0225  hypothetical protein  53.25 
 
 		 268 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3352  protein of unknown function DUF82  51.43 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.729294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3276  protein of unknown function DUF82  51.37 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.31629  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1812  protein of unknown function DUF82  48.96 
 
 		 261 aa  215  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0418  hypothetical protein  46.92 
 
 		 262 aa  214  9e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4229  protein of unknown function DUF82  45.78 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4339  protein of unknown function DUF82  45.78 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.172322 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10590  hypothetical protein  45.15 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.18585e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02617  hypothetical protein  41.89 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3080  protein of unknown function DUF82  38.52 
 
 		 261 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.367373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3040  protein of unknown function DUF82  38.11 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0327  hypothetical protein  39.75 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359144  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0149  hypothetical protein  39.5 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0147  hypothetical protein  39.5 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0281  protein of unknown function DUF82  37.92 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1988  protein of unknown function DUF82  38.02 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.865468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0859  hypothetical protein  36.95 
 
 		 267 aa  161  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.015676 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1285  hypothetical protein  40.18 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1519  hypothetical protein  33.47 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00627759  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2400  protein of unknown function DUF82  38.32 
 
 		 268 aa  135  8e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3958  protein of unknown function DUF82  30.95 
 
 		 243 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2002  protein of unknown function DUF82  34.84 
 
 		 241 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1548  hypothetical protein  29.6 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0341  protein of unknown function DUF82  37.25 
 
 		 158 aa  106  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00210637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7452  protein of unknown function DUF82  32.38 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_368  hypothetical protein  37.16 
 
 		 167 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0577491  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0403  hypothetical protein  35.76 
 
 		 167 aa  99.8  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.393997  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0100  protein of unknown function DUF82  36.36 
 
 		 235 aa  99.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.566034  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1175  protein of unknown function DUF82  31.61 
 
 		 176 aa  86.7  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2621  hypothetical protein  36.3 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0155  hypothetical protein  32.53 
 
 		 166 aa  77.8  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.292503  normal  0.0192044 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0072  hypothetical protein  33.78 
 
 		 158 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.0153972 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0758  hypothetical protein  32.28 
 
 		 161 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0747  hypothetical protein  31.82 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1471  hypothetical protein  32 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.863306  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1053  hypothetical protein  31.58 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1033  hypothetical protein  31.54 
 
 		 148 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1020  hypothetical protein  33.75 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.134843 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1425  hypothetical protein  30.86 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0872  protein of unknown function DUF82  33.77 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.340382  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1691  hypothetical protein  33.76 
 
 		 193 aa  62  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000104629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1962  protein of unknown function DUF82  30.52 
 
 		 155 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00000351454  decreased coverage  0.00501017 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1591  hypothetical protein  31.54 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0441  protein of unknown function DUF82  31.14 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.297493 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1779  hypothetical protein  31.1 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000347212 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1135  protein of unknown function DUF82  29.52 
 
 		 164 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.132995  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3160  hypothetical protein  33.92 
 
 		 176 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2987  protein of unknown function DUF82  32.48 
 
 		 153 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2635  protein of unknown function DUF82  31.33 
 
 		 158 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0051  thiamineS protein  36.84 
 
 		 84 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0508  hypothetical protein  27.14 
 
 		 136 aa  47  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0988512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1819  thiamineS protein  35.06 
 
 		 84 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  38.3 
 
 		 79 aa  45.8  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.36 
 
 		 74 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1167  hypothetical protein  30.77 
 
 		 126 aa  43.9  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1283  hypothetical protein  37.5 
 
 		 93 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  36.62 
 
 		 82 aa  42.7  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2809  thiamineS protein  32 
 
 		 85 aa  42.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>