62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1053 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1053  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  301  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0758  hypothetical protein  42.96 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1033  hypothetical protein  45.83 
 
 
148 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1962  protein of unknown function DUF82  44.06 
 
 
155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00000351454  decreased coverage  0.00501017 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0341  protein of unknown function DUF82  37.68 
 
 
158 aa  91.7  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00210637  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0418  hypothetical protein  35.92 
 
 
262 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0872  protein of unknown function DUF82  31.97 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.340382  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1175  protein of unknown function DUF82  31.29 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0155  hypothetical protein  31.08 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.292503  normal  0.0192044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0174  hypothetical protein  31.58 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  32.68 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0441  protein of unknown function DUF82  28.75 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.297493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0327  hypothetical protein  33.55 
 
 
255 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359144  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1135  protein of unknown function DUF82  29.05 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.132995  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3686  protein of unknown function DUF82  33.8 
 
 
253 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000683757  hitchhiker  0.000000000000406532 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2635  protein of unknown function DUF82  33.58 
 
 
158 aa  61.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0859  hypothetical protein  31.72 
 
 
267 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.015676 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1988  protein of unknown function DUF82  29.93 
 
 
254 aa  61.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.865468  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0217  hypothetical protein  32.43 
 
 
247 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2987  protein of unknown function DUF82  29.05 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3160  hypothetical protein  36.24 
 
 
176 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3405  hypothetical protein  33.09 
 
 
254 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000396149  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0270  hypothetical protein  33.1 
 
 
251 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318554  hitchhiker  0.00000949427 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2878  hypothetical protein  31.21 
 
 
251 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000157183  hitchhiker  0.00000000000184345 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3352  protein of unknown function DUF82  30.28 
 
 
252 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.729294  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2800  hypothetical protein  32.37 
 
 
259 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0306  hypothetical protein  32.37 
 
 
259 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00785467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3802  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142796  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3123  hypothetical protein  34.03 
 
 
251 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0157534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0031  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3863  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1634  hypothetical protein  30.87 
 
 
251 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0225  hypothetical protein  32.37 
 
 
268 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0403  hypothetical protein  31.29 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.393997  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0233  hypothetical protein  31.65 
 
 
255 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0265996  hitchhiker  0.00000000670922 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2621  hypothetical protein  28.29 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02617  hypothetical protein  29.25 
 
 
257 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_368  hypothetical protein  30 
 
 
167 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0577491  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2158  hypothetical protein  30.99 
 
 
264 aa  53.5  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0147  hypothetical protein  27.27 
 
 
247 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0209  hypothetical protein  31.16 
 
 
246 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121486  unclonable  0.00000000000711775 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0149  hypothetical protein  27.27 
 
 
247 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4339  protein of unknown function DUF82  28.48 
 
 
258 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.172322 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4229  protein of unknown function DUF82  28.48 
 
 
258 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0146  hypothetical protein  31.03 
 
 
251 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.865977  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1548  hypothetical protein  28.87 
 
 
258 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0072  hypothetical protein  28.19 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.0153972 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1812  protein of unknown function DUF82  30.83 
 
 
261 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3080  protein of unknown function DUF82  27.27 
 
 
261 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.367373  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3040  protein of unknown function DUF82  26.62 
 
 
261 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3276  protein of unknown function DUF82  30.99 
 
 
252 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.31629  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3958  protein of unknown function DUF82  28.67 
 
 
243 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0281  protein of unknown function DUF82  28.47 
 
 
267 aa  45.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0219  protein of unknown function DUF82  35.37 
 
 
167 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.375339  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2400  protein of unknown function DUF82  27.78 
 
 
268 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2002  protein of unknown function DUF82  30.17 
 
 
241 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1425  hypothetical protein  25.53 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1471  hypothetical protein  24.82 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.863306  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1167  hypothetical protein  28.67 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0600  hypothetical protein  36.92 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476447  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10590  hypothetical protein  28.37 
 
 
252 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.18585e-17  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2642  hypothetical protein  36.73 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>