14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM02360 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006682  CNM02360  expressed protein  100 
 
 		 527 aa  1076    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35882  RNA exonuclease NGL2 (Carbon catabolite repressor protein 4 homolog)  24.81 
 
 		 463 aa  126  9e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42429  predicted protein  26.16 
 
 		 625 aa  69.7  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55298  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (Cytoplasmic deadenylase) (Carbon catabolite repressor protein 4)  25 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00447743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43289  predicted protein  26.36 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43396  predicted protein  26.36 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37824  predicted protein  26.09 
 
 		 304 aa  59.7  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.725866  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  21.36 
 
 		 675 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26071  predicted protein  22.69 
 
 		 578 aa  57.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.465211 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03790  conserved hypothetical protein  19.86 
 
 		 744 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48873  predicted protein  23.08 
 
 		 808 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.424343  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26290  predicted protein  23.94 
 
 		 349 aa  48.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.176681 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45096  predicted protein  24.28 
 
 		 765 aa  47.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37444  predicted protein  22.68 
 
 		 382 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00833047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>