108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2393 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2393  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
277 aa  569  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  61.68 
 
 
276 aa  363  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0093  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  50 
 
 
294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.82 
 
 
288 aa  279  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0267  endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.04 
 
 
291 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50 
 
 
271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.635423  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3567  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.39 
 
 
286 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202667  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6287  hypothetical protein  51.6 
 
 
274 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72430  hypothetical protein  51.6 
 
 
292 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0340  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  52.03 
 
 
291 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0159  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.4 
 
 
290 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.171713  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5100  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.8 
 
 
284 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0779207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0128  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.63 
 
 
284 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503703  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0145  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.63 
 
 
284 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01980  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  52.05 
 
 
286 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.496471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0143  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.24 
 
 
284 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0051  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.6 
 
 
292 aa  248  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.171004 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2601  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  47.27 
 
 
282 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.792599  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.58 
 
 
290 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.742577  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04435  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.45 
 
 
255 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45 
 
 
245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.325788  normal  0.617389 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.56 
 
 
256 aa  225  6e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.4725  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0781  hypothetical protein  44.35 
 
 
256 aa  217  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.44 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  42.39 
 
 
250 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2166  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.34 
 
 
286 aa  192  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1193  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.2 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.04 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.59 
 
 
837 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.92 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.19 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.92 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.88 
 
 
808 aa  72.8  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  29.39 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.27 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.32 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.82 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.34 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.49 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.15 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.75 
 
 
236 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1010  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.46 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.91 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.94 
 
 
257 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.2 
 
 
257 aa  63.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.47 
 
 
271 aa  59.3  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.72 
 
 
269 aa  59.3  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.09 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4059  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.2 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.26 
 
 
288 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.29 
 
 
245 aa  53.1  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.84 
 
 
246 aa  52.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.89 
 
 
278 aa  52.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.84 
 
 
246 aa  52.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.37 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.6 
 
 
282 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.22 
 
 
289 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.98 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.64 
 
 
261 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.64 
 
 
261 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.64 
 
 
300 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.673881  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.44 
 
 
279 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.99 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.75 
 
 
591 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.19 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.44 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.35 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.69 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.11 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.41 
 
 
312 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  25 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.43 
 
 
264 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.25 
 
 
282 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.07 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1349  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.86 
 
 
287 aa  46.6  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.442404  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.83 
 
 
255 aa  46.6  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.83 
 
 
255 aa  46.6  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32760  metal-dependent hydrolase  34.26 
 
 
251 aa  46.2  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.244056  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.51 
 
 
255 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.51 
 
 
255 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.51 
 
 
255 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  27.51 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.72 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.97 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.35 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  33.7 
 
 
369 aa  45.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0040  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.12 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  43.1 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3798  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.46 
 
 
263 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00159012  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.75 
 
 
639 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.66 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0409  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.21 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596587  normal  0.0713633 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2394  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.19 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.97 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4337  putative metal-dependent hydrolase  27.13 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.25 
 
 
265 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0102  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.8 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.78 
 
 
233 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0472  hypothetical protein  30.29 
 
 
240 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
292 aa  43.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>