99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2166 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2166  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
286 aa  590  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0093  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.38 
 
 
294 aa  218  7e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.9 
 
 
276 aa  218  7.999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.03 
 
 
288 aa  206  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.85 
 
 
271 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.635423  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04435  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.67 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3567  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.71 
 
 
286 aa  199  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202667  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.57 
 
 
290 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.742577  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2601  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  42.46 
 
 
282 aa  198  7e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.792599  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.08 
 
 
256 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.4725  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.15 
 
 
245 aa  194  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.325788  normal  0.617389 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2393  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.34 
 
 
277 aa  192  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0051  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.45 
 
 
292 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.171004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5100  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.87 
 
 
284 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0779207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0159  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.89 
 
 
290 aa  188  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.171713  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0781  hypothetical protein  44.26 
 
 
256 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0340  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  41.94 
 
 
291 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72430  hypothetical protein  42.28 
 
 
292 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6287  hypothetical protein  42.28 
 
 
274 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01980  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  42.69 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.496471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0267  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.13 
 
 
291 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0143  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.65 
 
 
284 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0128  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.65 
 
 
284 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503703  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0145  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.65 
 
 
284 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  37.66 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.66 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.91 
 
 
253 aa  82  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.91 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.06 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1193  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.27 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.29 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.18 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.02 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.11 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.33 
 
 
283 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.2 
 
 
837 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.73 
 
 
281 aa  63.5  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.37 
 
 
246 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.38 
 
 
248 aa  62.8  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  28.03 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2394  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24 
 
 
243 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.05 
 
 
266 aa  59.3  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.47 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.13 
 
 
242 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.1 
 
 
245 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.16 
 
 
328 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.15 
 
 
271 aa  55.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.44 
 
 
328 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.98 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.38 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  29.2 
 
 
273 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.86 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.38 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3480  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.99 
 
 
276 aa  52.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.78 
 
 
257 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.71 
 
 
249 aa  52.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.14 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.03 
 
 
235 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.73 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.71 
 
 
249 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.56 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.47 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1247  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.34 
 
 
437 aa  51.2  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.59 
 
 
808 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.81 
 
 
576 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  28.99 
 
 
232 aa  50.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1391  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.25 
 
 
250 aa  49.3  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  25.09 
 
 
286 aa  48.9  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.27 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.64 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 
278 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  27.34 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.31 
 
 
242 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4386  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.46 
 
 
269 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.48 
 
 
639 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4059  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.74 
 
 
260 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.47 
 
 
255 aa  46.6  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.7 
 
 
228 aa  46.6  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.47 
 
 
255 aa  46.6  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.88 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.82 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.55 
 
 
258 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.17 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.17 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.17 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.65 
 
 
244 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.6 
 
 
242 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.82 
 
 
285 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.2 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2405  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.41 
 
 
280 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730344  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.93 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  26.09 
 
 
639 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.79 
 
 
264 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2562  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.52 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1010  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.12 
 
 
261 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.73 
 
 
261 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.48 
 
 
252 aa  42.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.89 
 
 
269 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.73 
 
 
261 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>