62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2702 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2702  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
232 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1309  endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.87 
 
 
246 aa  205  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.226265  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.81 
 
 
235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  47.44 
 
 
232 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.54 
 
 
249 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0478352  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6062  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.32 
 
 
236 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3237  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.5 
 
 
251 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.207462  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2759  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.14 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429259  decreased coverage  0.00000225225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3505  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.87 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.02 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11820  metal-dependent hydrolase  32.49 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.502125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.65 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  33.98 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2205  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.43 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.586211  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.26 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.78 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.56 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.17 
 
 
312 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.11 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.59 
 
 
282 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.87 
 
 
246 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.08 
 
 
244 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.36 
 
 
236 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.29 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.09 
 
 
298 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.08 
 
 
271 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.2 
 
 
250 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.1 
 
 
235 aa  52  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.92 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.14 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.97 
 
 
328 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.97 
 
 
328 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
283 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.87 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.86 
 
 
242 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  26.46 
 
 
270 aa  48.9  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.5 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  28.23 
 
 
673 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.7 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.4 
 
 
231 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.57 
 
 
257 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.7 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.02 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.2 
 
 
252 aa  45.4  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.82 
 
 
249 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.38 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.25 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1226  hypothetical protein  23.94 
 
 
346 aa  43.9  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0434503 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.25 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.96 
 
 
279 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4059  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.16 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1916  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.86 
 
 
230 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.56 
 
 
282 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.88 
 
 
245 aa  43.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.53 
 
 
287 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4016  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.38 
 
 
276 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.25 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  30.68 
 
 
245 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.69 
 
 
639 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3419  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.16 
 
 
339 aa  42.4  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.04 
 
 
245 aa  42.4  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.66 
 
 
288 aa  42  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>