106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2639 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
288 aa  587  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2393  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.61 
 
 
277 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0093  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  49 
 
 
294 aa  255  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.39 
 
 
276 aa  252  6e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2601  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  49.6 
 
 
282 aa  248  8e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.792599  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3567  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.31 
 
 
286 aa  248  9e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0340  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  48.25 
 
 
291 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0267  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.8 
 
 
291 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6287  hypothetical protein  49.8 
 
 
274 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01980  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  50.77 
 
 
286 aa  242  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.496471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72430  hypothetical protein  49.39 
 
 
292 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0143  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.42 
 
 
284 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5100  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.83 
 
 
284 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0779207 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04435  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.43 
 
 
255 aa  239  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0051  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.6 
 
 
292 aa  238  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.171004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0128  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.61 
 
 
284 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503703  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0159  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.38 
 
 
290 aa  236  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.171713  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0145  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.61 
 
 
284 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.35 
 
 
245 aa  236  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.325788  normal  0.617389 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.75 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.4725  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.96 
 
 
271 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.635423  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0781  hypothetical protein  45.93 
 
 
256 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.4 
 
 
290 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.742577  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2166  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.08 
 
 
286 aa  209  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  37.45 
 
 
250 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.75 
 
 
258 aa  186  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1193  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.32 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.15 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.23 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.58 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.8 
 
 
837 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.43 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.2 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.07 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.18 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.67 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  29.46 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.79 
 
 
242 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.01 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.91 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.57 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.2 
 
 
246 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.35 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.2 
 
 
246 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.28 
 
 
269 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.51 
 
 
257 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1916  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.4 
 
 
230 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.32 
 
 
808 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.34 
 
 
285 aa  56.2  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.99 
 
 
265 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.97 
 
 
285 aa  55.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.97 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.32 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.87 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.87 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.16 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.97 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  25.18 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.1 
 
 
258 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.84 
 
 
258 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.65 
 
 
261 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.65 
 
 
261 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.56 
 
 
576 aa  52.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1010  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.98 
 
 
261 aa  52.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.71 
 
 
591 aa  52  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  38.55 
 
 
369 aa  52  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.22 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.29 
 
 
639 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.32 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.01 
 
 
278 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.85 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.85 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.89 
 
 
250 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.5 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.55 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4059  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
260 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.11 
 
 
312 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.2 
 
 
278 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3480  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.07 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28 
 
 
300 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.673881  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.76 
 
 
300 aa  48.9  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.1 
 
 
288 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  27.98 
 
 
232 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  29.41 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.75 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.39 
 
 
249 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.06 
 
 
289 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  31.4 
 
 
277 aa  46.6  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.29 
 
 
644 aa  46.2  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4386  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.87 
 
 
269 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.96 
 
 
235 aa  45.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0040  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.97 
 
 
329 aa  45.8  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.16 
 
 
278 aa  45.8  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.93 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.09 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  25.5 
 
 
639 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.74 
 
 
260 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>