81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0093 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0093  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
294 aa  605  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.74 
 
 
290 aa  291  7e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.742577  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2393  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49 
 
 
288 aa  254  9e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.02 
 
 
276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3567  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.52 
 
 
286 aa  245  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0267  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.18 
 
 
291 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5100  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.4 
 
 
284 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0779207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01980  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  47.47 
 
 
286 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.496471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0143  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46 
 
 
284 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72430  hypothetical protein  46.37 
 
 
292 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6287  hypothetical protein  46.37 
 
 
274 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0145  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46 
 
 
284 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0128  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46 
 
 
284 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503703  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0051  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.46 
 
 
292 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.171004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0340  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  46.37 
 
 
291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.53 
 
 
271 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.635423  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0159  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.72 
 
 
290 aa  221  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.171713  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04435  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.9 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2166  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.38 
 
 
286 aa  218  7e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2601  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  41.86 
 
 
282 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.792599  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.13 
 
 
256 aa  215  8e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.4725  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0781  hypothetical protein  43.32 
 
 
256 aa  207  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.21 
 
 
245 aa  206  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.325788  normal  0.617389 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.75 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  39.33 
 
 
250 aa  195  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.09 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.29 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1193  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.38 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.27 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.11 
 
 
808 aa  69.3  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.08 
 
 
248 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.24 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1010  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.05 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.72 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.38 
 
 
269 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.05 
 
 
283 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2394  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.31 
 
 
243 aa  59.7  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.37 
 
 
328 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.9 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  28.37 
 
 
245 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.37 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.22 
 
 
837 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.54 
 
 
258 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.96 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.97 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.97 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.06 
 
 
312 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.56 
 
 
255 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.85 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.48 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.81 
 
 
639 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.04 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.04 
 
 
261 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 
282 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  26.77 
 
 
286 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  26.74 
 
 
617 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.97 
 
 
242 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.84 
 
 
242 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1247  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.35 
 
 
437 aa  48.5  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  24.91 
 
 
639 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.81 
 
 
591 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.9 
 
 
236 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4386  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.9 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.9 
 
 
242 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.44 
 
 
257 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.16 
 
 
285 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.37 
 
 
250 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.67 
 
 
285 aa  46.2  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.62 
 
 
253 aa  46.2  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.59 
 
 
282 aa  45.8  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  30.43 
 
 
369 aa  45.8  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.67 
 
 
644 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.71 
 
 
285 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.74 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11820  metal-dependent hydrolase  28.69 
 
 
244 aa  43.5  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.502125  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.28 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.673881  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  24.89 
 
 
302 aa  43.1  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.33 
 
 
233 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.36 
 
 
257 aa  43.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.51 
 
 
246 aa  42.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>