97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3480 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3480  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
276 aa  526  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.75 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.96 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.96 
 
 
255 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.96 
 
 
255 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4386  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.17 
 
 
269 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2356  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.27 
 
 
259 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  normal  0.0671284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0808  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.62 
 
 
257 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.555445  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2507  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.91 
 
 
260 aa  122  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366976  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3798  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.69 
 
 
263 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00159012  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0330  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.35 
 
 
262 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0263555  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1174  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.08 
 
 
257 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834262  normal  0.168848 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0929  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.98 
 
 
259 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391996  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.76 
 
 
281 aa  86.3  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0040  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.99 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.6 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.45 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.22 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.74 
 
 
837 aa  67  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.4 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.82 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.82 
 
 
257 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.27 
 
 
644 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.21 
 
 
257 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.28 
 
 
269 aa  63.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.72 
 
 
278 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4122  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.1 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.08 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.57 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.99 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  28.89 
 
 
657 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.78 
 
 
283 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  30.26 
 
 
286 aa  59.7  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.11 
 
 
236 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.82 
 
 
808 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.83 
 
 
242 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2166  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.7 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.93 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.35 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.35 
 
 
258 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  34.55 
 
 
316 aa  56.6  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3567  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.32 
 
 
286 aa  55.8  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202667  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.1 
 
 
253 aa  55.8  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
328 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.17 
 
 
288 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4283  Metal-dependent exonuclease protein  26.05 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.16 
 
 
328 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.17 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.56 
 
 
242 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.69 
 
 
242 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.41 
 
 
271 aa  52.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.635423  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0781  hypothetical protein  27.14 
 
 
256 aa  52.4  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.22 
 
 
279 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2766  hypothetical protein  26.35 
 
 
281 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1349  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.58 
 
 
287 aa  50.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.442404  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.97 
 
 
639 aa  49.3  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.77 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.4725  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.94 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2601  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.46 
 
 
282 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.792599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0267  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.62 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  25.45 
 
 
245 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.69 
 
 
312 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01980  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.68 
 
 
286 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.496471  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  29.81 
 
 
639 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  28.78 
 
 
617 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04435  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.76 
 
 
255 aa  46.2  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.06 
 
 
288 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.85 
 
 
282 aa  45.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.25 
 
 
288 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.97 
 
 
576 aa  45.4  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.24 
 
 
591 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72430  hypothetical protein  28.27 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.51 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.51 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.6 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1289  hypothetical protein  27.47 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal  0.614576 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.97 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.12 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.73 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533258  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2679  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.49 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00635777  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  30.69 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2093  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.03 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0340  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.7 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6261  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.34 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.34 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5100  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.76 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0779207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6287  hypothetical protein  26.74 
 
 
274 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1455  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.32 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271612  normal  0.540274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.63 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.3 
 
 
264 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.51 
 
 
258 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.63 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0159  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.9 
 
 
290 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.171713  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.09 
 
 
276 aa  42.7  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1077  hypothetical protein  24.56 
 
 
790 aa  42.7  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2393  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.58 
 
 
277 aa  42.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.57 
 
 
248 aa  42.4  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>