85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2356 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2356  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 259 aa  502  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  normal  0.0671284 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2507  endonuclease/exonuclease/phosphatase  81.78 
 
 		 260 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366976  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4386  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.3 
 
 		 269 aa  208  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3798  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.75 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00159012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.74 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.74 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.74 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0808  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.42 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.555445  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.22 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0929  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.76 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1174  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.15 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834262  normal  0.168848 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0330  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.22 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0263555  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3480  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.98 
 
 		 276 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0040  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.66 
 
 		 329 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.64 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.6 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  31.25 
 
 		 286 aa  68.6  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.2 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  33.81 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 		 808 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.92 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.02 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.75 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.6 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.03 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.15 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.68 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.97 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  27.34 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.62 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.59 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.03 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.08 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.67 
 
 		 328 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.82 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.16 
 
 		 282 aa  52.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.8 
 
 		 266 aa  52.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.41 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.94 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.18 
 
 		 271 aa  52  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.86 
 
 		 837 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.4 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.72 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0964  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.32 
 
 		 287 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.04 
 
 		 269 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.47 
 
 		 242 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.76 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.28 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.56 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.13 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.05 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.21 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.07 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.72 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.07 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.07 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3504  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.02 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40759  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.54 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.9 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.9 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.09 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.15 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 		 265 aa  45.4  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.38 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.41 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.74 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.68 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.06 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.18 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  26.8 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1729  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.48 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102373  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.8 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1364  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.83 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.204083  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.89 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.64 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1756  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.95 
 
 		 286 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.35 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  34.85 
 
 		 321 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2228  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.16 
 
 		 286 aa  42.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.36 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25 
 
 		 1153 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1156  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.68 
 
 		 370 aa  42  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.876276  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.91 
 
 		 259 aa  42  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.07 
 
 		 252 aa  42  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>