75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3237 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3237  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 251 aa  468  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.207462  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.15 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0478352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  37.45 
 
 		 232 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.65 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2702  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.5 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2205  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.4 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.586211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2759  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.13 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429259  decreased coverage  0.00000225225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6062  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.66 
 
 		 236 aa  85.9  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3505  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.4 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443664 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1309  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.66 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.226265  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.1 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.88 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.1 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.35 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.86 
 
 		 837 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11820  metal-dependent hydrolase  33.6 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.502125  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 		 808 aa  57.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.78 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.62 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32760  metal-dependent hydrolase  37.2 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.244056  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.72 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.5 
 
 		 278 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.02 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.28 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  29.8 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.35 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.15 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.74 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0821  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.62 
 
 		 281 aa  52.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.46 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.7 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.69 
 
 		 328 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.69 
 
 		 328 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.06 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.73 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.29 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0014  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.84 
 
 		 277 aa  49.3  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.8 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.32 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.17 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  31.3 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.51 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.37 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.52 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1156  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.35 
 
 		 370 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.876276  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.86 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.76 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.2 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.71 
 
 		 261 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.68 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.68 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2515  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.07 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.45 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.67 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.45 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2424  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.14 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.97 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.6 
 
 		 644 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5036  aminoacyl-tRNA hydrolase  30.71 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.33 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  49.06 
 
 		 657 aa  42.7  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.97 
 
 		 259 aa  42.7  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3052  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.88 
 
 		 271 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.88 
 
 		 271 aa  42.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0781  hypothetical protein  28.51 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3071  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.88 
 
 		 271 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.6 
 
 		 263 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.88 
 
 		 271 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.6 
 
 		 263 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00774  hypothetical protein  26.61 
 
 		 253 aa  42  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2853  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.61 
 
 		 253 aa  42  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0844  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.61 
 
 		 253 aa  42  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00757  predicted DNase  26.61 
 
 		 253 aa  42  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0938  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.38 
 
 		 253 aa  42  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>