87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32760 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_32760  metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 251 aa  488  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.244056  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2205  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.64 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.586211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.6 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0478352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2759  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.15 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429259  decreased coverage  0.00000225225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.52 
 
 		 235 aa  99.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1309  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.82 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.226265  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2702  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.33 
 
 		 232 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  36.1 
 
 		 232 aa  87.8  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6062  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.71 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11820  metal-dependent hydrolase  35.37 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.502125  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3237  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.45 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.207462  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.68 
 
 		 808 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.74 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.74 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3505  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.98 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443664 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.64 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  30.04 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.2 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.84 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.72 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.09 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.37 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.35 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.47 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.35 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.28 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.33 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4059  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.17 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.24 
 
 		 837 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.08 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.09 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.68 
 
 		 282 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.19 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.89 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.82 
 
 		 289 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.23 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  38.66 
 
 		 617 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 		 288 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.95 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2393  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.81 
 
 		 277 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.15 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.87 
 
 		 292 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2405  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 		 280 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  39.76 
 
 		 286 aa  48.9  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.07 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3419  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  20.28 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.05 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.5 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.12 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.1 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.12 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0051  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.73 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.2 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.61 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.43 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6287  hypothetical protein  30.7 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.28 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.4725  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.74 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.23 
 
 		 328 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5100  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.59 
 
 		 284 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0779207 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.6 
 
 		 285 aa  45.8  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.29 
 
 		 283 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72430  hypothetical protein  30.23 
 
 		 292 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0781  hypothetical protein  31.34 
 
 		 256 aa  45.4  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.75 
 
 		 240 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.14 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0267  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.59 
 
 		 291 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1402  AP endonuclease domain-containing protein  28.72 
 
 		 310 aa  45.4  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0340  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.59 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.2 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1572  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.93 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.816455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  32.38 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.23 
 
 		 328 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.17 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.77 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.93 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0093  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 294 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.3 
 
 		 358 aa  43.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.69 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.92 
 
 		 271 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.07 
 
 		 252 aa  43.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0472  hypothetical protein  26.34 
 
 		 240 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.46 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2124  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.34 
 
 		 240 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.908976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>