66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2205 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2205  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 260 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.586211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32760  metal-dependent hydrolase  45.8 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.244056  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2759  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.58 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429259  decreased coverage  0.00000225225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3237  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.58 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.207462  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.1 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0478352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.4 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  30.4 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1309  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.22 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.226265  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2702  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.24 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.52 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.02 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11820  metal-dependent hydrolase  29.64 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.502125  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.52 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.18 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.1 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3505  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.2 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443664 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.1 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.88 
 
 		 808 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.25 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6062  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.95 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.3 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.34 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.87 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.1 
 
 		 837 aa  52.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.13 
 
 		 285 aa  52  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.6 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.79 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.95 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.8 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.35 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.85 
 
 		 298 aa  49.3  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.23 
 
 		 644 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.95 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.97 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.92 
 
 		 328 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.09 
 
 		 228 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6287  hypothetical protein  29.68 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 288 aa  46.6  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.66 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0128  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.32 
 
 		 284 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0145  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.32 
 
 		 284 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5100  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.22 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0779207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.92 
 
 		 328 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72430  hypothetical protein  29.68 
 
 		 292 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0472  hypothetical protein  32.57 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2124  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.57 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.908976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0267  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.78 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.71 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4016  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0143  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.68 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.48 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.34 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0340  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.78 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.66 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0051  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 292 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0159  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.06 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.171713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.42 
 
 		 292 aa  42.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.29 
 
 		 246 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.64 
 
 		 269 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.06 
 
 		 269 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.43 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.97 
 
 		 282 aa  42.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2176  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.33 
 
 		 269 aa  42.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.67 
 
 		 236 aa  42  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.51 
 
 		 282 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>