50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1842 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1842  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  100 
 
 
286 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1350.1  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  99.65 
 
 
324 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0665906  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1114  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  99.65 
 
 
286 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  99.65 
 
 
286 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187821  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2196  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  99.3 
 
 
286 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0055  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  99.65 
 
 
286 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2361  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  99.3 
 
 
286 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2228  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  94.04 
 
 
286 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  73.94 
 
 
284 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533258  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1842  endonuclease/exonuclease/phosphatase  72.18 
 
 
284 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1729  endonuclease/exonuclease/phosphatase  71.13 
 
 
284 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102373  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1756  endonuclease/exonuclease/phosphatase  71.13 
 
 
286 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6261  endonuclease/exonuclease/phosphatase  71.83 
 
 
284 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  71.83 
 
 
284 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1455  endonuclease/exonuclease/phosphatase  70.53 
 
 
285 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271612  normal  0.540274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0964  endonuclease/exonuclease/phosphatase  65.73 
 
 
287 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1289  hypothetical protein  57.79 
 
 
290 aa  325  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal  0.614576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2093  endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.82 
 
 
284 aa  288  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2113  endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.19 
 
 
284 aa  278  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0578211  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1208  hypothetical protein  49.48 
 
 
289 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1052  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.85 
 
 
287 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00191941  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1144  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.85 
 
 
287 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2766  hypothetical protein  47.18 
 
 
281 aa  239  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2351  hypothetical protein  57.36 
 
 
226 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.286388  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3303  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.29 
 
 
291 aa  209  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2656  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.57 
 
 
291 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1364  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.81 
 
 
301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.204083  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5302  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.23 
 
 
289 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4122  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.51 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1349  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.32 
 
 
287 aa  92  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.442404  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4283  Metal-dependent exonuclease protein  27.33 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.54 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.09 
 
 
288 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  36.59 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.7 
 
 
271 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.16 
 
 
278 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.82 
 
 
328 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.32 
 
 
328 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4024  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.63 
 
 
278 aa  55.8  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.41 
 
 
235 aa  53.1  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.29 
 
 
231 aa  49.7  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.72 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.7 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3504  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.45027 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.87 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.43 
 
 
260 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.28 
 
 
263 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.28 
 
 
263 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.28 
 
 
258 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>