69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0964 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0964  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 287 aa  584  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1756  endonuclease/exonuclease/phosphatase  67.48 
 
 		 286 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  66.2 
 
 		 284 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1842  endonuclease/exonuclease/phosphatase  66.2 
 
 		 284 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108875 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6261  endonuclease/exonuclease/phosphatase  66.2 
 
 		 284 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1729  endonuclease/exonuclease/phosphatase  67.48 
 
 		 284 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102373  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  65.03 
 
 		 284 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1455  endonuclease/exonuclease/phosphatase  65.73 
 
 		 285 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271612  normal  0.540274 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2228  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  66.78 
 
 		 286 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  66.08 
 
 		 286 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1114  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  66.08 
 
 		 286 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1842  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  65.73 
 
 		 286 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2361  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  65.73 
 
 		 286 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0055  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  66.08 
 
 		 286 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1350.1  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  66.08 
 
 		 324 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0665906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2196  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  66.08 
 
 		 286 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1289  hypothetical protein  60.41 
 
 		 290 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal  0.614576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2093  endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.61 
 
 		 284 aa  301  6.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2113  endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.36 
 
 		 284 aa  298  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0578211  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2351  hypothetical protein  62.94 
 
 		 226 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.286388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1144  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.3 
 
 		 287 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1052  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.14 
 
 		 287 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00191941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2766  hypothetical protein  45.99 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1208  hypothetical protein  43.94 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1364  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.73 
 
 		 301 aa  215  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.204083  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3303  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.26 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2656  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.93 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5302  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.27 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.16 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4122  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.19 
 
 		 287 aa  94  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4283  Metal-dependent exonuclease protein  29.47 
 
 		 286 aa  92.8  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.47 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1349  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.25 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.442404  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.72 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  36.53 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.43 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.43 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3504  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.95 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.45027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4024  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.44 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.44 
 
 		 328 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.44 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.57 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  28.67 
 
 		 617 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.8 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.44 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.76 
 
 		 242 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.1 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.2 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.24 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.6 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5408  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.74 
 
 		 634 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.43 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.25 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.63 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.63 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.37 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.94 
 
 		 808 aa  46.2  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.57 
 
 		 278 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.12 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.09 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.09 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  28.23 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.29 
 
 		 231 aa  43.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.33 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5653  exodeoxyribonuclease III Xth  30.95 
 
 		 260 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.248061 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  28.33 
 
 		 285 aa  43.1  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  28.35 
 
 		 252 aa  42.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  27.42 
 
 		 262 aa  42.7  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.43 
 
 		 253 aa  42.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>