More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2271 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 
252 aa  524  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  65.6 
 
 
251 aa  343  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  61.75 
 
 
251 aa  335  5e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  59.68 
 
 
252 aa  330  9e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  59.76 
 
 
250 aa  329  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  61.85 
 
 
250 aa  328  4e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  58.5 
 
 
252 aa  327  9e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  58.5 
 
 
252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  58.5 
 
 
252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  58.5 
 
 
252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  60.16 
 
 
250 aa  325  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  61.45 
 
 
250 aa  325  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  57.71 
 
 
252 aa  324  9e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  57.71 
 
 
252 aa  323  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  57.71 
 
 
252 aa  322  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  58.96 
 
 
253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  55.78 
 
 
251 aa  298  8e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  57.58 
 
 
262 aa  293  2e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  53.17 
 
 
257 aa  284  7e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  54.25 
 
 
249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  54.94 
 
 
259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  53.17 
 
 
249 aa  280  2e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  53.04 
 
 
249 aa  278  5e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  54.72 
 
 
253 aa  275  7e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  49.13 
 
 
285 aa  270  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  52.96 
 
 
253 aa  265  5e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  49.4 
 
 
253 aa  257  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  49.02 
 
 
268 aa  248  9e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  45.88 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  49.02 
 
 
257 aa  236  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1528  exonuclease III  43.01 
 
 
272 aa  227  1e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.7 
 
 
258 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  42.19 
 
 
255 aa  215  4e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  45.88 
 
 
255 aa  215  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  45.1 
 
 
257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  45.45 
 
 
248 aa  214  8e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  44.57 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  45.56 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  44.79 
 
 
259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  42.75 
 
 
255 aa  208  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1090  exodeoxyribonuclease III Xth  42.03 
 
 
275 aa  208  8e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406253  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  43.14 
 
 
254 aa  206  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  42.34 
 
 
274 aa  204  8e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.88161  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1508  3'-exo-deoxyribonuclease  42.81 
 
 
275 aa  203  2e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000904963  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  42.17 
 
 
251 aa  202  5e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  42.52 
 
 
254 aa  202  6e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  41.18 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0034  exonuclease III  40.36 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  41.47 
 
 
257 aa  199  3e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  40 
 
 
252 aa  198  5e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  43.43 
 
 
247 aa  198  6e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  42.29 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  41.09 
 
 
252 aa  196  3e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_5808  predicted protein  46.35 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000562371  normal  0.329515 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1659  exonuclease III  39.42 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  40.39 
 
 
252 aa  195  6e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  40.39 
 
 
252 aa  193  2e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  39.7 
 
 
268 aa  193  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  39.37 
 
 
254 aa  192  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  41.18 
 
 
251 aa  191  9e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1563  exodeoxyribonuclease  40.58 
 
 
275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  43.19 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  43.19 
 
 
253 aa  189  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  40.47 
 
 
256 aa  189  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0841  exonuclease III  40.43 
 
 
285 aa  188  8e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  38.82 
 
 
259 aa  187  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  38.82 
 
 
259 aa  187  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  38.82 
 
 
259 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.03 
 
 
237 aa  185  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  41.25 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.86 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  37.74 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  40.08 
 
 
255 aa  182  6e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  38.04 
 
 
257 aa  181  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.04 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  38.04 
 
 
257 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  38.91 
 
 
254 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  38.04 
 
 
257 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  40.86 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  37.89 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  38.13 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  38.91 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  38.04 
 
 
259 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  37.65 
 
 
257 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  38.04 
 
 
259 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.65 
 
 
257 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  39 
 
 
253 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  37.65 
 
 
257 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  37.25 
 
 
256 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.74 
 
 
258 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  38.58 
 
 
270 aa  177  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  37.98 
 
 
259 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  39.3 
 
 
260 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  39.3 
 
 
260 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  38.04 
 
 
254 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4050  exodeoxyribonuclease III Xth  37.93 
 
 
262 aa  174  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0277  exodeoxyribonuclease III Xth  37.36 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273673  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  36.86 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  40.93 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  36.86 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>