More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5653 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5653  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 260 aa  535  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.248061 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  43.63 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  44.02 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  39 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  42.21 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  40.54 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  41.83 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  41.31 
 
 		 254 aa  188  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  40.3 
 
 		 258 aa  188  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  41.44 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  39.77 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  36.5 
 
 		 256 aa  185  6e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  38.35 
 
 		 264 aa  184  9e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  41.92 
 
 		 254 aa  184  9e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  41.44 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  41.06 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05580  Exodeoxyribonuclease III  40.94 
 
 		 281 aa  182  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1727  exodeoxyribonuclease III Xth  38.78 
 
 		 258 aa  182  7e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  39.46 
 
 		 258 aa  182  7e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  36.29 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  38.02 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  38.78 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4983  exodeoxyribonuclease III Xth  38.58 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5986  exodeoxyribonuclease III Xth  41.6 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  38.49 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  36.7 
 
 		 261 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  39.38 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  39.38 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  37.97 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2221  exodeoxyribonuclease III  40.84 
 
 		 270 aa  175  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  38.01 
 
 		 264 aa  175  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  39.25 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  40.54 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  40.46 
 
 		 269 aa  175  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0470  exodeoxyribonuclease III Xth  38.35 
 
 		 289 aa  174  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  38.35 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  38.4 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3799  exodeoxyribonuclease III  40.08 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  37.55 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4299  exodeoxyribonuclease III Xth  40.15 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231101  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  36.88 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  36.29 
 
 		 267 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  37.79 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2707  exodeoxyribonuclease III, putative  39.92 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0579  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.31 
 
 		 274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3045  exodeoxyribonuclease III  39.92 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0213415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  36.67 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  39.16 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1001  exodeoxyribonuclease III  35.36 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  41.54 
 
 		 258 aa  171  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1868  exodeoxyribonuclease III  39.92 
 
 		 264 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0445089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  38.72 
 
 		 266 aa  171  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2898  exodeoxyribonuclease III  39.92 
 
 		 284 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0371  exodeoxyribonuclease III  36.14 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.226435  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  33.58 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25800  Exodeoxyribonuclease III  38.43 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  38.46 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  37.55 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  37.13 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  33.21 
 
 		 281 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  37.13 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  37.6 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0877  exodeoxyribonuclease III Xth  38.64 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278743 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  37.45 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  37.16 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  36.43 
 
 		 275 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  37.27 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3424  exodeoxyribonuclease III  39.39 
 
 		 272 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.903718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  36.43 
 
 		 265 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4910  exodeoxyribonuclease III  39.31 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.38033  decreased coverage  0.000445359 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  36.4 
 
 		 271 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0675  exodeoxyribonuclease III  36.49 
 
 		 281 aa  169  6e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.107108  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  36.4 
 
 		 271 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  36.4 
 
 		 272 aa  168  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  36.78 
 
 		 258 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09930  putative exonuclease III  38.93 
 
 		 266 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0994533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  36.78 
 
 		 258 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  35.63 
 
 		 258 aa  168  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1180  exodeoxyribonuclease III  38.06 
 
 		 304 aa  168  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.08 
 
 		 260 aa  168  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0921  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 		 261 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  36.96 
 
 		 261 aa  168  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.515839  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0209  exodeoxyribonuclease III xth  38.43 
 
 		 237 aa  168  9e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  36.78 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2668  exodeoxyribonuclease III Xth  37.02 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3648  exodeoxyribonuclease III Xth  36.98 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  38.93 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  38.17 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3010  exodeoxyribonuclease III Xth  39.54 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  37.31 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  35.58 
 
 		 260 aa  166  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0730  exodeoxyribonuclease III Xth  35.87 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32166 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  37.69 
 
 		 265 aa  165  5e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.22 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  37.64 
 
 		 265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  36.43 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  33.09 
 
 		 281 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0579  exodeoxyribonuclease III  36.16 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201053  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  34.72 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1207  exodeoxyribonuclease III (xth)  36.64 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>