More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2776 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 260 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  85.38 
 
 		 267 aa  470  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  72.48 
 
 		 261 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  69.65 
 
 		 258 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  70.82 
 
 		 258 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  70.82 
 
 		 258 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  71.98 
 
 		 258 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  67.7 
 
 		 258 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  68.87 
 
 		 274 aa  378  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  68.09 
 
 		 256 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  65.37 
 
 		 254 aa  346  3e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  64.86 
 
 		 254 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  59.02 
 
 		 269 aa  314  7e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  57.84 
 
 		 275 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  57.14 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  57.52 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  58.3 
 
 		 255 aa  308  4e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  58.91 
 
 		 258 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  58.24 
 
 		 258 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  58.24 
 
 		 258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  57.85 
 
 		 322 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  57.85 
 
 		 258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  57.85 
 
 		 258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  57.85 
 
 		 258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  57.85 
 
 		 258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  57.85 
 
 		 258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  57.85 
 
 		 258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  57.85 
 
 		 258 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  56.72 
 
 		 265 aa  305  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  58.53 
 
 		 272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  58.91 
 
 		 258 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  58.53 
 
 		 258 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  58.53 
 
 		 258 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  54.47 
 
 		 254 aa  296  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  56.98 
 
 		 271 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  56.98 
 
 		 271 aa  295  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  56.81 
 
 		 255 aa  295  4e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  55.81 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  55.25 
 
 		 277 aa  292  3e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  54.47 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  53.49 
 
 		 256 aa  287  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  54.86 
 
 		 255 aa  285  7e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1252  exodeoxyribonuclease III Xth  51.64 
 
 		 282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010877  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  53.09 
 
 		 288 aa  281  5.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.60209 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  50.96 
 
 		 267 aa  268  8.999999999999999e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  52.11 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  50.38 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  51.55 
 
 		 258 aa  265  5e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  49.62 
 
 		 257 aa  262  4.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.645227  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  52.69 
 
 		 264 aa  261  6e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  52.31 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03249  exodeoxyribonuclease III  50.77 
 
 		 259 aa  258  7e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  48.65 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  48.26 
 
 		 256 aa  254  8e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  48.11 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  47.62 
 
 		 268 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  48.3 
 
 		 261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  49.42 
 
 		 257 aa  245  4.9999999999999997e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  51.16 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  51.16 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0209  exodeoxyribonuclease III xth  47.68 
 
 		 237 aa  242  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  46.24 
 
 		 265 aa  241  9e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  46.07 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  46.82 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 		 281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  42.16 
 
 		 281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  43.82 
 
 		 275 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  43.23 
 
 		 262 aa  228  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  43.23 
 
 		 262 aa  228  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  42.16 
 
 		 281 aa  228  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  42.7 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  42.7 
 
 		 277 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  40.59 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  43.07 
 
 		 279 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  41.15 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  41.15 
 
 		 267 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  43.07 
 
 		 288 aa  208  6e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  41.15 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  42.91 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  39.92 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  40.38 
 
 		 263 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  41.15 
 
 		 261 aa  202  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  42.59 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  40.38 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  40 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  40.61 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  40.31 
 
 		 279 aa  198  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  39.62 
 
 		 263 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  40.31 
 
 		 260 aa  198  9e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  39.38 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  40.23 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  38.4 
 
 		 265 aa  195  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  38.85 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  39.23 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0675  exodeoxyribonuclease III  36.82 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.107108  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1683  exodeoxyribonuclease III  43.02 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  38.91 
 
 		 258 aa  191  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  39.46 
 
 		 263 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  40.38 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2815  exodeoxyribonuclease III  40.31 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0879261  normal  0.730816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>