More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15770 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 259 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  65.76 
 
 		 261 aa  351  5.9999999999999994e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  64.09 
 
 		 265 aa  328  4e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  63.32 
 
 		 265 aa  328  7e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1469  exodeoxyribonuclease III  59.57 
 
 		 282 aa  318  3.9999999999999996e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  57.03 
 
 		 264 aa  293  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05580  Exodeoxyribonuclease III  56.25 
 
 		 281 aa  293  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  58.62 
 
 		 275 aa  293  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0629  exodeoxyribonuclease III Xth  55.64 
 
 		 268 aa  289  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4983  exodeoxyribonuclease III Xth  58.56 
 
 		 264 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  52.87 
 
 		 263 aa  285  5.999999999999999e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  56.32 
 
 		 264 aa  285  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5290  exodeoxyribonuclease III Xth  58.08 
 
 		 297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.024265  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0419  exodeoxyribonuclease III  55.97 
 
 		 294 aa  281  7.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0177  exodeoxyribonuclease III Xth  57.04 
 
 		 272 aa  279  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.990944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1180  exodeoxyribonuclease III  57.69 
 
 		 304 aa  278  8e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10432  exodeoxyribonuclease III protein xthA (exonuclease III)  55.85 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0709218  normal  0.817281 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  55.13 
 
 		 266 aa  275  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0730  exodeoxyribonuclease III Xth  56.67 
 
 		 272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32166 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0579  exodeoxyribonuclease III  57.14 
 
 		 267 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201053  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0470  exodeoxyribonuclease III Xth  54.23 
 
 		 289 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0567  exodeoxyribonuclease III  57.14 
 
 		 267 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0557  exodeoxyribonuclease III  57.14 
 
 		 267 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2428  exodeoxyribonuclease III Xth  52.67 
 
 		 264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3648  exodeoxyribonuclease III Xth  54.02 
 
 		 263 aa  271  7e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  53.64 
 
 		 264 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25800  Exodeoxyribonuclease III  52.96 
 
 		 266 aa  268  8.999999999999999e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1079  exodeoxyribonuclease III  52.65 
 
 		 262 aa  261  8.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3810  exodeoxyribonuclease III Xth  51.91 
 
 		 293 aa  256  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01950  Exodeoxyribonuclease III  50.91 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3155  exodeoxyribonuclease III Xth  46.35 
 
 		 316 aa  241  7e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0656  exodeoxyribonuclease III Xth  49.62 
 
 		 262 aa  238  5.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  47.31 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  44.06 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  43.41 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1727  exodeoxyribonuclease III Xth  49.22 
 
 		 258 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  43.63 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1068  exodeoxyribonuclease III Xth  44.53 
 
 		 262 aa  202  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  42.8 
 
 		 277 aa  201  7e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  42.02 
 
 		 255 aa  200  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  43.97 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  42.41 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  42.31 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  42.8 
 
 		 261 aa  198  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  43.8 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  40.23 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  42.02 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  41.76 
 
 		 258 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  42.53 
 
 		 254 aa  195  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  42.58 
 
 		 258 aa  194  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  42.15 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  41.86 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  40.53 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  42.15 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  41.31 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  43.63 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  42.53 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  42.53 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  42.53 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  42.53 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 		 258 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  41.86 
 
 		 271 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  42.53 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  42.53 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  42.53 
 
 		 322 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  40.15 
 
 		 259 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  43.68 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  41.47 
 
 		 271 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  39.69 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  40.86 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  41.86 
 
 		 272 aa  188  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  40.15 
 
 		 256 aa  188  8e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  43.58 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  43.58 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  42.41 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  33.71 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  40.3 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  40.3 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  42.47 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  41.09 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  37.93 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  35.23 
 
 		 281 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  41.38 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  38.4 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  41.47 
 
 		 258 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  36.12 
 
 		 275 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  41.47 
 
 		 258 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  35.61 
 
 		 281 aa  185  6e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  39.7 
 
 		 275 aa  185  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  41.47 
 
 		 258 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  41.31 
 
 		 257 aa  185  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  38.04 
 
 		 288 aa  184  8e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.60209 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  39.08 
 
 		 261 aa  184  9e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  36.74 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  38.85 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1920  exodeoxyribonuclease III  38.46 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.19654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  40.38 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>