More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2428 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2428  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 264 aa  545  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  75.29 
 
 		 263 aa  408  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  68.44 
 
 		 264 aa  369  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  66.92 
 
 		 266 aa  363  1e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  65.9 
 
 		 264 aa  362  2e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3648  exodeoxyribonuclease III Xth  63.88 
 
 		 263 aa  354  6.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4983  exodeoxyribonuclease III Xth  64.39 
 
 		 264 aa  352  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3155  exodeoxyribonuclease III Xth  59.81 
 
 		 316 aa  353  2e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0419  exodeoxyribonuclease III  63.06 
 
 		 294 aa  349  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  62.5 
 
 		 264 aa  343  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25800  Exodeoxyribonuclease III  64.77 
 
 		 266 aa  341  7e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0629  exodeoxyribonuclease III Xth  61.94 
 
 		 268 aa  341  9e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  61.69 
 
 		 275 aa  340  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10432  exodeoxyribonuclease III protein xthA (exonuclease III)  61.51 
 
 		 291 aa  331  6e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0709218  normal  0.817281 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05580  Exodeoxyribonuclease III  59.64 
 
 		 281 aa  331  7.000000000000001e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0656  exodeoxyribonuclease III Xth  59.47 
 
 		 262 aa  326  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1079  exodeoxyribonuclease III  59.4 
 
 		 262 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0177  exodeoxyribonuclease III Xth  60.74 
 
 		 272 aa  318  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.990944 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01950  Exodeoxyribonuclease III  58.55 
 
 		 275 aa  315  7e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0730  exodeoxyribonuclease III Xth  58.46 
 
 		 272 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32166 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0579  exodeoxyribonuclease III  58.05 
 
 		 267 aa  309  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201053  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0567  exodeoxyribonuclease III  58.05 
 
 		 267 aa  309  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0557  exodeoxyribonuclease III  57.68 
 
 		 267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  52.67 
 
 		 259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1180  exodeoxyribonuclease III  52.24 
 
 		 304 aa  260  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5290  exodeoxyribonuclease III Xth  50.75 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.024265  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  49.24 
 
 		 265 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  49.24 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3810  exodeoxyribonuclease III Xth  47.57 
 
 		 293 aa  242  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1469  exodeoxyribonuclease III  45.55 
 
 		 282 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  47.73 
 
 		 261 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0470  exodeoxyribonuclease III Xth  48.48 
 
 		 289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  38.87 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1727  exodeoxyribonuclease III Xth  42.42 
 
 		 258 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1068  exodeoxyribonuclease III Xth  42.05 
 
 		 262 aa  188  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  40.07 
 
 		 322 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  41.13 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  40.53 
 
 		 258 aa  185  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  40.53 
 
 		 258 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  40.6 
 
 		 258 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  40.53 
 
 		 258 aa  185  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  40.53 
 
 		 258 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  40.53 
 
 		 258 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  40.53 
 
 		 258 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  41.2 
 
 		 254 aa  184  9e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  39.08 
 
 		 256 aa  182  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  40.53 
 
 		 258 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  39.47 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  40.77 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  38.31 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  39.77 
 
 		 258 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  37.93 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  39.46 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  38.64 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  39.39 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  39.39 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  39.92 
 
 		 254 aa  175  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  38.93 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  37.88 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  38.93 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  39.08 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  39.62 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  39.62 
 
 		 258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  40.75 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  40.75 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  39.92 
 
 		 254 aa  171  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  38.58 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  38.17 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  36.88 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  34.34 
 
 		 261 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  37.21 
 
 		 256 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  38.02 
 
 		 256 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  37.93 
 
 		 258 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  37.79 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  38.37 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  40.98 
 
 		 259 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  36.53 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  37.83 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  38.64 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  37.08 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  37.64 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2921  exodeoxyribonuclease III Xth  39.02 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  36.53 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  38.49 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  35.74 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  35.74 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  35.85 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  37.45 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  36.7 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  37.55 
 
 		 258 aa  165  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1920  exodeoxyribonuclease III  36.88 
 
 		 262 aa  165  9e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.19654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  36.36 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  36.6 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  37.26 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  37.22 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  32.45 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  36.23 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  35.63 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  35.21 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>