More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4983 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4983  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 264 aa  537  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  75.29 
 
 		 266 aa  401  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  69.58 
 
 		 264 aa  391  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0419  exodeoxyribonuclease III  71.27 
 
 		 294 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  70.99 
 
 		 275 aa  378  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10432  exodeoxyribonuclease III protein xthA (exonuclease III)  70.68 
 
 		 291 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0709218  normal  0.817281 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0629  exodeoxyribonuclease III Xth  68.28 
 
 		 268 aa  376  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0579  exodeoxyribonuclease III  67.54 
 
 		 267 aa  360  9e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201053  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0567  exodeoxyribonuclease III  67.54 
 
 		 267 aa  360  9e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0557  exodeoxyribonuclease III  67.16 
 
 		 267 aa  358  5e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0730  exodeoxyribonuclease III Xth  67.77 
 
 		 272 aa  357  9e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0177  exodeoxyribonuclease III Xth  68.52 
 
 		 272 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.990944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3648  exodeoxyribonuclease III Xth  69.85 
 
 		 263 aa  357  9.999999999999999e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  65.53 
 
 		 264 aa  354  7.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2428  exodeoxyribonuclease III Xth  64.39 
 
 		 264 aa  352  2e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  65.27 
 
 		 264 aa  342  2.9999999999999997e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  63.64 
 
 		 263 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25800  Exodeoxyribonuclease III  65.53 
 
 		 266 aa  342  4e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1079  exodeoxyribonuclease III  65.28 
 
 		 262 aa  341  7e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3155  exodeoxyribonuclease III Xth  57.28 
 
 		 316 aa  337  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05580  Exodeoxyribonuclease III  63.37 
 
 		 281 aa  333  2e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01950  Exodeoxyribonuclease III  62.77 
 
 		 275 aa  332  4e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0656  exodeoxyribonuclease III Xth  59.62 
 
 		 262 aa  311  6.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  58.56 
 
 		 259 aa  288  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  55.94 
 
 		 265 aa  278  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  55.94 
 
 		 265 aa  278  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1180  exodeoxyribonuclease III  55.47 
 
 		 304 aa  270  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5290  exodeoxyribonuclease III Xth  54.68 
 
 		 297 aa  268  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.024265  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1469  exodeoxyribonuclease III  52.14 
 
 		 282 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0470  exodeoxyribonuclease III Xth  52.08 
 
 		 289 aa  251  8.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  50.38 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3810  exodeoxyribonuclease III Xth  50.38 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  43.94 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  44.7 
 
 		 254 aa  206  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1727  exodeoxyribonuclease III Xth  48.67 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  41.98 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  41.44 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  43.24 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  43.13 
 
 		 255 aa  194  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  43.23 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  39.54 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  39.54 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  40.91 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  40.38 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 258 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 322 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  43.08 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  38.87 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  41.22 
 
 		 260 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  42.8 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1068  exodeoxyribonuclease III Xth  44.36 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  41.13 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  40.75 
 
 		 259 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  40.75 
 
 		 258 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  43.23 
 
 		 264 aa  188  8e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  41.67 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  36.98 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  40.38 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  41.22 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  40.91 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  36.33 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  40.75 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  41.98 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  41.18 
 
 		 268 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  42.86 
 
 		 264 aa  185  6e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  41.67 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  40.91 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  41.67 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.84 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  40.84 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  39.62 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  40.84 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  41.22 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  40.45 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  40.38 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  39.47 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3799  exodeoxyribonuclease III  38.02 
 
 		 256 aa  181  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  40.08 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  40.08 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  39.62 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4299  exodeoxyribonuclease III Xth  38.35 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231101  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  39.39 
 
 		 267 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03249  exodeoxyribonuclease III  41.51 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5653  exodeoxyribonuclease III Xth  38.58 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.248061 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  40.38 
 
 		 282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  37.74 
 
 		 277 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  42.05 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  42.05 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  40.46 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  35.09 
 
 		 281 aa  178  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  33.71 
 
 		 281 aa  178  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  38.11 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  38.89 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  39.26 
 
 		 269 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>