More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1315 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  99.61 
 
 		 259 aa  524  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  92.66 
 
 		 259 aa  497  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  74.9 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0897  exodeoxyribonuclease III  70.3 
 
 		 268 aa  397  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2815  exodeoxyribonuclease III  73.85 
 
 		 261 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0879261  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  70.5 
 
 		 261 aa  376  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  64.31 
 
 		 263 aa  333  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  65.49 
 
 		 263 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  64.31 
 
 		 264 aa  329  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  61.63 
 
 		 262 aa  325  5e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  61.24 
 
 		 261 aa  324  9e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  61 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  60.62 
 
 		 263 aa  317  9e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  60.62 
 
 		 279 aa  317  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  60.23 
 
 		 260 aa  316  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  59.85 
 
 		 262 aa  315  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  59.3 
 
 		 263 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  60.15 
 
 		 262 aa  312  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  59.3 
 
 		 263 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  60.38 
 
 		 263 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  57.36 
 
 		 263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  58.4 
 
 		 264 aa  308  8e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  58.78 
 
 		 264 aa  308  8e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  58.91 
 
 		 267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  57.63 
 
 		 264 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  58.69 
 
 		 258 aa  303  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  57.36 
 
 		 276 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  58.46 
 
 		 270 aa  300  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1920  exodeoxyribonuclease III  58.04 
 
 		 262 aa  297  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.19654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0660  exodeoxyribonuclease III  53.88 
 
 		 263 aa  294  1e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969043  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  56.59 
 
 		 266 aa  294  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0692  exodeoxyribonuclease III  53.88 
 
 		 263 aa  294  1e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000190547  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1683  exodeoxyribonuclease III  59.69 
 
 		 258 aa  291  5e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122396 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  56.2 
 
 		 266 aa  290  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2921  exodeoxyribonuclease III Xth  58.17 
 
 		 264 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  55.21 
 
 		 269 aa  280  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  54.65 
 
 		 259 aa  279  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0156  exodeoxyribonuclease III  54.44 
 
 		 259 aa  277  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2180  exodeoxyribonuclease III (xth)  55.38 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3911  exodeoxyribonuclease III  56.49 
 
 		 271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  51.16 
 
 		 258 aa  271  7e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  52.9 
 
 		 261 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.515839  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3456  exodeoxyribonuclease III Xth  53.08 
 
 		 303 aa  267  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1784  exodeoxyribonuclease III  53.21 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144543  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  53.46 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  51.55 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5537  exodeoxyribonuclease III Xth  52.9 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  52.51 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4910  exodeoxyribonuclease III  52.51 
 
 		 283 aa  261  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.38033  decreased coverage  0.000445359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  51.74 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0921  exodeoxyribonuclease III  51.74 
 
 		 261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5986  exodeoxyribonuclease III Xth  51.35 
 
 		 270 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3045  exodeoxyribonuclease III  50.57 
 
 		 265 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0213415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09930  putative exonuclease III  51.74 
 
 		 266 aa  250  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0994533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2221  exodeoxyribonuclease III  50.58 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1868  exodeoxyribonuclease III  48.66 
 
 		 264 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0445089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2707  exodeoxyribonuclease III, putative  50.19 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2668  exodeoxyribonuclease III Xth  50.57 
 
 		 260 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0877  exodeoxyribonuclease III Xth  48.45 
 
 		 264 aa  245  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3424  exodeoxyribonuclease III  48.46 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.903718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4299  exodeoxyribonuclease III Xth  49.61 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231101  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  48.84 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3010  exodeoxyribonuclease III Xth  49.43 
 
 		 265 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1386  exodeoxyribonuclease III Xth  48.06 
 
 		 263 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.031293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  46.69 
 
 		 254 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2898  exodeoxyribonuclease III  48.26 
 
 		 284 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3799  exodeoxyribonuclease III  48.06 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1491  exodeoxyribonuclease III Xth  47.67 
 
 		 264 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.74554 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3068  exodeoxyribonuclease III Xth  51.92 
 
 		 255 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  48.25 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3728  exodeoxyribonuclease III Xth  49.42 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1207  exodeoxyribonuclease III (xth)  49.03 
 
 		 256 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0579  exodeoxyribonuclease III (xth)  47.88 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3423  exodeoxyribonuclease III  50.97 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  44.92 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  42.8 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  42.41 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0446  exodeoxyribonuclease III Xth  48.06 
 
 		 258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  44.36 
 
 		 254 aa  211  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  43.75 
 
 		 257 aa  208  9e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  43.02 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0675  exodeoxyribonuclease III  39.27 
 
 		 281 aa  206  4e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.107108  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  42.26 
 
 		 282 aa  203  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  39.39 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  40.93 
 
 		 277 aa  199  5e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  45.38 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  45.38 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0371  exodeoxyribonuclease III  38.63 
 
 		 279 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.226435  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  41.38 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  41 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  41 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  41 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  41 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  41 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  41 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  41 
 
 		 322 aa  194  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  42.02 
 
 		 267 aa  194  9e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  42.48 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  40.15 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>